鞘脂质由聚糖结构组成，该聚糖结构附着在含有鞘脂质神经酰胺的脂质尾部。神经酰胺由含14C至20C的鞘氨醇组成，脂族链以酰胺键连接在鞘氨醇氨基上，其长度从16C至26C不等。鞘磷脂的不饱和程度往往因其物种起源的多样性、存在的组织部位和发现它的生理状态而异。鞘糖脂的糖链通过糖苷键与神经酰胺的主羟基部分连接。糖链可以是单糖或多糖，是构成鞘糖脂的另一种重要结构，比神经酰胺复杂得多。其主要成分有d -葡萄糖、d -半乳糖、l -聚焦、d -甘露糖、n -乙酰氨基葡萄糖(GlcNAc)、n -乙酰氨基半乳糖(GalNAc)和唾液酸(SA)。
鞘糖脂主要分布在哺乳动物组织细胞质膜的外叶和胞内膜中。鞘糖脂的疏水部分的特殊结构使其能够更稳定地嵌入细胞膜双分子层，而亲水部分则延伸到细胞质膜外进行一系列的生命活动。
近年来质谱技术的迅速发展，极大地拓宽了薄层色谱/高效液相色谱和高效液相色谱/超高效液相色谱技术的应用范围。糖链结构的高度异质性及其异构体的广泛性要求分析仪器具有更好的定量分析能力。高效液相色谱-电喷雾电离-四极离子捕集时间飞行质谱(hplc -电喷雾电离-四极离子捕集时间飞行质谱- ms、HPLC-ESI-QIT-TOF-MS)和多级串联质谱(MSn)可以满足这种需求。
从组织或细胞样品中提取鞘糖脂后，可以用正相或反相柱纯化，然后用LC-ESI-MS/MS进行分析。
正向色谱LC-ESI-MS/MS提取鞘糖脂样品时，将样品细胞或组织在一定比例的氯仿、甲醇、水或一定比例的异丙醇、正己烷、水中超声释放粗脂。然后在弱碱性环境中进行皂化反应，从结果中去除甘油糖脂。鞘糖脂通过氯仿、甲醇或Folch法提取分离，并准备LC-ESI-MS/MS研究。
相反，反相色谱柱LC-ESI-MS/MS路线是在超声后分离纯化离子交换deae -葡聚糖凝胶柱，然后用反相色谱柱LC-ESI-MS/MS结合MS多反应监测(MRM)技术对鞘糖脂进行定量研究。
对鞘糖脂的分离研究可以减少结构复杂和可变的神经酰胺的异质性的影响。多糖可以通过酶消化或化学消化从鞘糖脂分子中分离出来。
酶促反应使用神经酰胺多糖内切酶，一种来自特定无脊椎动物和细菌的酶，它可以打破连接神经酰胺和多糖的糖苷键，释放糖链。
化学消解通过臭氧化或锇催化氧化高碘酸盐来破坏鞘氨醇的C-C键来释放多糖，然后与碱处理进行β -消除反应。