胃肠道中真菌、病毒、细菌和原生动物的总和以及它们的全部遗传物质描述了一个有机体的肠道微生物群。必须支持在不同人群中定义微生物多样性的研究。结果可以帮助设计未来的治疗方法,以恢复超人类的机体健康。
肠道微生物多样性分析通常采用16S/18S/ITS扩增子测序平台。通过利用下一代测序技术和其他分子技术,它能够有效地表征微生物的多样性。创造性的蛋白质组学专家利用这个平台极大地帮助我们的客户,同时满足监管要求。我们的团队由大约70%的博士科学家组成,我们先进的测序平台,如我们的PacBio系统和Illumina PE250/300可以满足不同的测序需求。
关于我们的服务
我们创新的微生物多样性检测平台,结合先进的测序技术和定量PCR (qPCR),对16S/18S/ITS区域进行准确、高通量的分析。通过下一代测序(NGS)技术进行短读16S/18S/ITS测序,通过PacBio SMRT测序和纳米孔测序进行全长16S/18S/ITS测序。Sanger测序或qPCR与属和种特异性引物用于验证结果和量化微生物种类。利用16S/18S/ITS作为原核生物和真核生物的分子标记,我们的肠道微生物多样性平台可以进行原核生物多样性分析和真核生物多样性分析。
我们的优势:
- 微生物群落低丰度物种的检测
- 多年生命科学领域的商业经验
- 快捷实惠的服务
- 具有下一代和长读测序平台的尖端测序平台
- 灵活的测序策略和数据分析。
肠道微生物多样性分析流程
生物信息学分析
创造性的蛋白质组学提供可定制的一站式服务,提供高质量的分析,满足您的需求。生物信息学分析分为五个部分:数据QC、基因组组装、功能元件预测、基因功能注释和基因组比较分析。
生物信息学分析 | 问题解决 | |
物种的注释 | 物种注释和OUT聚类 | |
多样性分析 | α多样性 | 一个微生物生态系统的物种多样性 |
β多样性 | 不同环境下微生物群落多样性 | |
荟萃分析 | 来自不同来源的大数据集的比较研究 | |
进化分析 | 系统发育树的建立 | |
功能分析 | 肠道微生物区系分析 | 肠道细菌基因座检测、疾病预测与治疗 |
PICRUSt | 功能概要预测 | |
FAPROTAX | 生化周期预测 | |
Tax4fun | 功能概要预测 | |
FunGuild | 生态作用预测 | |
相关分析 | CCA | 微生物与环境的相关性 |
VPA | ||
网络分析 |
样品需求
在寄给我们样品之前,请确保它们符合以下要求:OD260/230≥1.8,1.8 < od260/280< 2.0,无降解或污染。在Illumina中,DNA的数量必须≥300 ng, PCR产物必须≥400 ng。在PacBio中,gDNA必须≥100 ng, PCR产物必须≥400 ng。
创造性的蛋白质组学提供高精度的肠道微生物多样性分析服务,希望能带来更有价值的见解,以研究这些微生物与人体之间的生物多样性和相互作用。我们的平台包括Illumina、Pacbio SMRT和Oxford Nanopore,可以满足您的需求,无论您感兴趣的目标是什么和多长时间。如果您对我们的amplicon测序服务感兴趣,并想了解更多,请随时访问联系我们!
引用:
1.肠道微生物组。成人短肠综合征.学术出版社,2019.
2.Das B, Ghosh TS, Kedia S,等。生活在海平面和高海拔地区的农村和城市健康印度人的肠道微生物组分析。科学报告.2018年,8(1)。
*只供研究用途。不用于诊断程序。