piwi - interaction RNAs (piRNAs),一般长度为21-36个核苷酸,是动物细胞中表达的最大的一类非编码小RNA分子。pirna主要由作为转座子陷阱的位点产生,提供rna介导的抗转座子扩张和入侵的适应性免疫,它们还可以参与生殖系细胞中其他遗传元素的调控。和其他小rna一样,piRNAs被认为参与了基因沉默,特别是转座子的沉默。其他功能包括保存基因组完整性,重塑常染色质和表观遗传编程,调节翻译,调节靶mRNA,调节mRNA稳定性,发育调节,等。
与其他小rna如miRNA和siRNA相比,对pirna的通路了解较少。由于piRNA序列和piwi功能在不同物种间的广泛差异,使得确定piRNA的功能变得困难,而且单个的piRNA并不保守,这使得对其功能的推断更具挑战性。虽然有研究表明pirna在生物发生、种系和大脑中具有一定的功能;piRNAs的异常表达与包括癌症在内的多种疾病有关。这些发现仍处于初步阶段,piRNAs是否与肠道菌群或肠脑轴有直接或间接的相互作用仍是一个有趣的研究课题。
图1所示。piwi - interaction RNA (piRNA)在表观遗传编程中的作用(Luteijn 2013)
创意蛋白质组学提供了piRNA分析和机制揭示的方法,包括基于下一代测序和piRNA微阵列的piRNA测序。
piRNA测序
我们通过使用下一代测序或大规模并行高通量DNA测序提供piRNA谱分析服务,允许检查组织特异性表达模式、疾病相关性或piRNA亚型,并发现以前未鉴定的piRNA。我们拥有先进的技术和经验丰富的专家,完全有能力:
◆从序列读取中获取piRNA丰度级别
◆发现小说Pirnas
◆确定差异表达的piRNA
◆确定piRNA相关基因沉默靶点
piRNA微阵列
微阵列是一种强大的高吞吐量工具,能够进行PiRNA机制的基因组分析,并行检测多个样品,并在单次运行中监测数千个小型非码RNA的表达。我们提供PiRNA微阵列分析的一站式服务,主要方案包括PiRNA oligo探针设计,阵列制造和PiRNA靶制剂,阵列探测杂交,信号检测和数据分析。该过程可以标准化并允许重复的piRNA分析。
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参考
1.Luteijn MJ, Ketting RF。piwi相互作用的rna:从一代到跨代的表观遗传学。自然遗传学评论。2013,14(8): 523 - 34。
*只供研究用途。不用于诊断程序。