肠道微生物纳纳米孔长读测序
下一代测序的引入具有革命性的分子生物学，并且现在通常用于系统孕组和偏见研究的高通量测序系统。虽然下一代测序限制了确保精度和保真度的过程的读取长度，但在分析大量扩增的相同DNA链的同时这样做。因为真核基因组包括许多重复性区域，因此长DNA分子必须分成小部分，这可能是真核DNA测序的显着约束。第三代测序技术可以序列比下一代测序更长的读取，因为它们立即序列单分子，导致高质量的基因组测序中的重整，使得不偏不倚，更精确的分类甚至比第二代测序更高的分类分辨率。肠道微生物A研究的方法。第三代测序已经超越了短读第二代测序信息组件的复杂性，并且无法有效地固定重复序列或巨大的基因组重排;它们都产生了很长的读取（1-100kb），这是下一代测序的唯一。
图1所示。纳米孔测序的原理和工作流程。(穆勒,2019)
关于我们纳米孔的长读测序服务
为了帮助您研究肠道微生物群，Creative Proteomics提供了第三代测序的前沿实验协议和算法技术。宏基因组测序、基因组重测序、基因组从头测序、转录组研究、甲基化鉴定、表观基因组实验、疾病相关变异检测、病毒分析和其他应用都可以从我们的第三代测序服务中受益。我们还提供第三代测序和下一代测序服务，以获得更精确的结果。定制化的服务将确保您的主题的高质量，并为您的研究提供额外的亮点概念，所以请联系我们了解更多合适的研究策略。
我们的优势
- 可映射的长度(> 2 Mb)稍微长一些
- 由于纳米孔可以序列众多分子，ont沟具有非常大的吞吐量
- 生成ONT数据的开销较小。由于测序成本是TGS应用的一个重要障碍，ONT相对较高的吞吐量和较低的价格使其在各种应用中都很有趣。
工作流程和生物信息学分析
| 生物信息学分析 | 细节 |
| 去除冗余 | 消除遗传冗余，即当两个或多个基因具有相同的目的时，其中一个基因的失活对生物表型几乎或没有影响。 |
| 基因功能分析 | 沿基因组的DNA序列识别任何功能元素，但首先侧重于基因。 |
| SNP打电话 | 植物基因组在遗传数据中的参考基因组变化，通常具有相关的置信度评分或统计证据度量。 |
| 基因表达分析 | 基因/转录本表达阶段的差异表达评估和定量 |
| 功能富集分析 | 分类基因或蛋白质类别在大量基因或蛋白质中过度表示，并且可以与疾病表型相关联。 |
| 质子泵抑制剂 | 检测和鉴定蛋白质相互作用。 |
创意蛋白质组学致力于提供最高水平的服务，促进肠道菌群研究。我们创新的ONT框架和服务将以他们的能力和奉献精神成为您最佳的全长测序合作伙伴。更多的细节和全面的报价，请联系我们。
参考资料
amarasinghe sl，su s，dong x，等．长读序列数据分析中的机遇与挑战。基因组生物学。2020年,21(1)。
2.MüllerCA，Boemo Ma，Spingardi P，等等。捕捉个体超长纳米孔序列上基因组复制的动态。自然方法．2019年,16(5)。
3.Kamathewatta KI, Bushell RN, Young ND，等．用牛津纳米孔长读测序技术探索兽医教学医院的抗生素耐药性风险．《公共科学图书馆•综合》．2019年,14(5)。
4.李文杰，唐思敏，罗曼。模拟微生物群落标准的超深、长读纳米孔测序。Gigascience．2019年5月; 8（5）。
*只供研究用途。不用于诊断程序。