宏基因组学和亚转录组学生物信息学分析
随着宏基因组和亚转录组测序技术的巨大进步，研究人员能够学习微生物群在纬度和在更深层面上——识别微生物物种甚至紧张,解释大量的数据可以应用于分类或功能分析在一个相当短的时间内,和微生物群与宏观观点健康状况…等metatscriptomic分析通过检测基因表达提供了对基因活动的深入了解，结合metagenomics和metatscriptomic分析将有助于更全面地理解微生物群，以促进基本解释和实际应用。
创造性的蛋白质组学作为一家卓越的多组学公司，拥有先进的技术和生物信息学平台，以及经验丰富的科学家，为您的肠道微生物群研究提供全面细致的生物信息学服务。我们提供多样化的数据分析服务，以满足您的宏基因组学和元转录组学项目的需求，包括但不限于:
| 预处理和质量控制过滤 | 顺序质量检查，移除适配器和低质量底座，清除污染，最终质量控制运行。 |
| 操作分类单元(OTU)分类 | 对read或contigs进行分组并分配给otu。分类方法可以基于组合特征和/或对齐(相似性)。 |
| 分类任务 | 在预先指定的参考序列数据库中搜索序列，用于分类实践。 |
| 丰富的表结构 | 构建OTU丰度表，其中表中的每个条目对应于每个OTU对应的每个样本观察到的读次数。 |
| 成分数据分析(CoDA) | 为合理、有原则地处理作曲数据提供了理论和方法。 |
| 归一化 | 识别和消除系统变异性，可以应用广泛的归一化方法对高维计数数据。 |
| -相对丰度计算 | 通过计算曲线下的总面积来描述一个物种相对于其他物种的常见或罕见程度。 |
| ——稀疏 | 从采样结果评估物种丰富度，并允许在构建稀疏曲线的基础上计算给定数量的个体样本的物种丰富度。 |
| 系统发育分析 | 系统发育树可用于获取样本间的系统发育距离。 |
| 多样性分析 | |
| -α多样性 | 一个特定样本内的多样性-一个栖息地或特定地区的平均物种多样性。 |
| -β多样性 | 样本之间的多样性——本地或阿尔法多样性和区域多样性之间的比率。 |
| 任命 | |
| -主成分分析(PCA) | 分析定量观察/变量表，相关或协方差矩阵。 |
| -主坐标分析(PCoA) | 探索和可视化一个方阵来描述数据的相似或不同。 |
| -非度量多维尺度(NMDS) | 一种间接梯度分析方法，根据距离或不相似矩阵产生排序。 |
| 多元微分丰度检验 | 检验两组或两组以上样品的微生物组成差异。 |
| 单变量差异丰度检验 | 识别与单一生物条件相关的微生物群。 |
| 数据注释 | 比较数据库中各个序列的读取，并为每个读取分配一个唯一的函数。 |
| 微生物的签名 | 当存在于人体栖息地的微生物类群一致地预测不同疾病或治疗的宿主表型时，这些微生物特征可用于建立基于个体特定微生物群的预测治疗结果的模型。 |
| 生物标志物的发现 | 识别生物体、基因或途径的生物标志物发现，一致地解释了两种或两种以上微生物群落之间的差异。 |
| 功能解释 | 互动探索和分析一个微生物群的功能潜力。 |
| 探索性数据分析 | 提供人类肠道宏基因组和元转录组的探索性分析服务。 |
结合最先进的技术和强大的分析平台，携带丰富的分析工具和先进的管道，我们有充分的能力来探索肠道微生物群落的分类和功能组成，对人类健康起着至关重要的作用。相应地，我们为您的肠道菌群研究提供全面细致的生物信息学服务，为我们的未来带来更多的祝福。如欲了解更多有关我们的生物信息服务以满足您的具体需求，请随时访问联系我们!
*只供研究用途。不用于诊断程序。
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