人体胃肠道被繁多的微生物,其中定植形态的细菌,病毒和真核微生物所特有的不同年龄,饮食习惯和健康状况的人的社区。肠道菌群在人类健康和健身举足轻重的作用。Metaproteomics是大规模鉴定和蛋白的定量,以研究从微生物群落的蛋白质的表达和功能,是一种多用途的工具,以提供深入了解在蛋白质水平上的微生物的表型。
二维液相色谱(2D-LC)是在元蛋白质组学研究中应用最广泛的多维液相色谱技术,可用于分离分子大小差异较大的蛋白、低丰度蛋白和疏水性蛋白。2D-LC是将两个不同的色谱柱依次连接起来,进样通过两个不同的分离阶段进行分离。2D-LC可用于解决自然发生的复杂混合物、各种生物条件的生物标志物、(meta)蛋白质组学和代谢组学的问题。与质谱联用时,2D-LC提供了大量的定性和定量数据,显著提高了检测深度,在蛋白质组学和宏蛋白质组学等领域复杂、难分离物质的分离中起着关键作用。然而,这些改进的分离通常是以较长的分析时间为代价的(例如,几个小时到几天),因此2D-LC确实是一种小众技术,仅限于所有液相分离的一小部分。
图1所示。离线2D LC/MS蛋白质组鉴定工作流程(Pieper 2013)
创造性的蛋白质组学作为具有多年经验的蛋白质组学一个卓越的公司。我们提出了有针对性的和不相关的metaproteomic分析了国家的最先进的2D-LC技术,我们还提供了2D-LC数据分析备选策略:
- 将2D-LC数据视为一系列1D色谱图,每个图都以或多或少的传统方式进行分析。
- 将2D-LC数据到当初2D图像,然后通过图像和特征分析的各种技术治疗。
- 数据的高阶结构(如2D-LC + MS)通过化学计量学方法进行处理分析,如并行因子分析(PARAFAC)、广义秩湮灭法(GRAM)或多元曲线分辨率交替最小二乘(MCR-ALS)。
我们致力于在肠道微生物群研究中提供最高级别的服务。我们将根据您的样品和研究目的提供最首选策略。要了解更多关于我们的2D-LC的服务,请随时联系我们。
参考
1.皮珀R等et al。蛋白质组学和Metaproteomics。在:纳尔逊K。(编辑)百科全书的宏基因组。2013年。
*仅供研究使用。不用于诊断过程。
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