GWAS (Genome-wide association study)是指利用基因组重测序技术,获取数百万个SNPs作为分子遗传标记,与表型数据进行联合分析,从中筛选出与疾病相关的SNPs,识别影响复杂性状的遗传变异。GWAS已经发现了大量的相关基因组变异位点,并在实践中发现了许多相关基因,但只能解释遗传力的一小部分。高通量、灵敏的大规模代谢组学研究方法的建立,使代谢组学和全基因组关联研究(mGWAS)的结合分析成为可能。
Creative Proteomic公司建立mGWAS分析平台。我们采用第二代测序技术获取群体材料的基因型数据,结合代谢组数据对代谢物进行全基因组关联分析。
mGWAS可用于高遗传效应基因的定位和基因功能研究,揭示许多影响人类代谢的遗传变异,为疾病机制研究提供新思路。对遗传影响的代谢类型的分析将加速代谢个性化研究,并有助于分析不同个体应对环境挑战的能力和对特定疾病的易感性。mGWAS目前被用于许多疾病的研究(如癌症、肥胖、心血管疾病、糖尿病、抑郁症和阿尔茨海默病)。
在植物和动物研究中,mGWAS可以批量定位控制代谢表型的相关候选基因(质量、功能性营养分子、等),揭示营养和品质等相关代谢途径的调控机制,有助于深入了解代谢遗传机制,并选育优质新品种。
一个代谢组学数据集与基因组学数据的集成工作流(Bilbreyet al。, 2021)。
样本类型 | |
GWAS |
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代谢组学 |
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参考