代谢组学创造性的蛋白质组学

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GWAS (Genome-wide association study)是指利用基因组重测序技术,获取数百万个SNPs作为分子遗传标记,与表型数据进行联合分析,从中筛选出与疾病相关的SNPs,识别影响复杂性状的遗传变异。GWAS已经发现了大量的相关基因组变异位点,并在实践中发现了许多相关基因,但只能解释遗传力的一小部分。高通量、灵敏的大规模代谢组学研究方法的建立,使代谢组学和全基因组关联研究(mGWAS)的结合分析成为可能。

Creative Proteomic公司建立mGWAS分析平台。我们采用第二代测序技术获取群体材料的基因型数据,结合代谢组数据对代谢物进行全基因组关联分析。

mGWAS可用于高遗传效应基因的定位和基因功能研究,揭示许多影响人类代谢的遗传变异,为疾病机制研究提供新思路。对遗传影响的代谢类型的分析将加速代谢个性化研究,并有助于分析不同个体应对环境挑战的能力和对特定疾病的易感性。mGWAS目前被用于许多疾病的研究(如癌症、肥胖、心血管疾病、糖尿病、抑郁症和阿尔茨海默病)。

在植物和动物研究中,mGWAS可以批量定位控制代谢表型的相关候选基因(质量、功能性营养分子、),揭示营养和品质等相关代谢途径的调控机制,有助于深入了解代谢遗传机制,并选育优质新品种。


技术路线图
结合代谢组和LncRNA

整合代谢组和LncRNA技术路线图

一个代谢组学数据集与基因组学数据集成的工作流程一个代谢组学数据集与基因组学数据的集成工作流(Bilbreyet al。, 2021)。

样品提交


样本类型
GWAS
  • 组织样本:≥100mg
  • 血液样本:≥0.5ml,建议使用EDTA抗凝管,避免肝素抗凝。
  • 唾液样本:≥1ml
  • 细胞样本:≥1×107
  • gDNA样品:浓度≥30ng/ul,总量≥2ug, OD260/280在1.8-2.0之间。不降解,不污染。
代谢组学
  • 血清/血浆:200 ul /样品
  • 脑脊液:300 ul /样品
  • 尿液:200 ul /样品
  • 组织:100毫克/样品
  • 粪便:5-10g /样品
  • 细胞:≥1 x107/样本

如果你想知道更多,请联系我们.期待与您的合作。

参考

  1. Bilbrey, e.a., Williamson, K.等人(2021年)。将基因组学与多平台代谢组学相结合,实现了与育种相关的苹果种质资源代谢产物QTL的检测。bioRxiv。
仅供研究用途。不用于诊断程序。

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