土壤在全球碳循环中发挥着重要作用。土壤有机质(SOM)的分子组成尚不清楚。土壤有机质的分子组成是研究陆地微生物群落结构和碳循环动态的基础。这些信息可用于理解和预测陆地生态系统在气候变化中的作用,例如,通过理解SOM的不稳定性及其与微生物活动的联系。
土壤代谢组学(soilomics)是研究土壤有机质和土壤微生物代谢含量变化及其相互作用的一种代谢组学方法。土壤微生物是陆地生态系统中不可或缺的土壤组分、分解者和调节者,可以参与生态系统的物质循环和能量流动。它们的分布和活性揭示了土壤的变化规律和演化趋势。
土壤中的代谢物主要来源于植物根间分泌物和微生物对有机物的降解。土壤微生物的代谢活动在生物残基分解、土壤结构形成、有机质转化、有毒物质降解等过程中起着至关重要的作用。研究土壤微生物碳代谢的功能特征,可以了解微生物多样性及其碳代谢能力,为探索土壤环境质量的调控和改善提供重要参考。
创造性的蛋白质组学使用诸多代谢组学以高通量和高灵敏度分析土壤中小分子的代谢谱。它还可以与多组学工具结合,如土壤微生物组的高通量测序,这有助于研究从微生物群落结构和功能到代谢途径的变化。另外,我们还可以提供有针对性的代谢组学对化合物进行定性和定量检测,加快相关研究进展的策略。
类别的代谢物 | 特定的代谢产物 |
羧酸及其衍生物 | 麦芽糖,甜菜碱,肌酐,鸟氨酸,γ -氨基丁酸,水水苷,尿囊酸,柠檬酸,马来酸… |
脂肪酰基 | 乙酰肉碱、泛酸、芥酸、肉豆蔻酸…… |
苯及其取代衍生物 | 乙酰水杨酸,水杨酸薄荷酯,嘧霉胺,苯胺,ceoin… |
Organonitrogen化合物 | 肉碱、N-octadecylamine胆色素原… |
有机氧化合物 | 蔗糖,木糖醇,n -糖酰神经氨酸,芦荟素.... |
周转时间:1 - 6周
分析类型 | 分析内容 |
质量控制 | TIC, QC等 |
概要分析 | 超类类别 |
方差分析 | 单变量统计分析(火山图等) |
多维统计分析(PCA, PLSDA, OPLSDA等) | |
功能分析 | 层序聚类分析 |
相关分析 | |
KEGG分析 | |
先进的分析 | WGCNA分析 |
回归分析 | |
聚类分析趋势 |
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