Metaprootomics是用于定性和定量分析微生物社区中蛋白质的研究，从而揭示分子水平的微生物表型信息。通过能够分离高度复杂的肽混合物，能够获得大量精确质谱信息的高分辨率质谱仪和能够加工和分析复杂数据的计算机工具的液相色谱，能够促进了液相色谱的发展。并使用液相色谱 - 串联质谱（LC-MS / MS），可以鉴定成千上万的肽。
从Metagenomics到Petaprootomics
肠道是一个复杂的生态系统。高通量的偏见研究方法，例如16S rRNA测序，广泛用于研究微生物社区的组成及其对人体健康和疾病的影响。研究表明，这些微生物社区与宿主抗病感染，先天免疫调节，炎症反应，营养吸收和通过代谢过程的能量平衡密切相关。不平衡的微生物社区通常导致心血管和脑血管疾病，例如肥胖症或糖尿病，甚至是动脉粥样硬化。
传统的微生物学研究并不能帮助我们理解这些细菌群落与宿主基因组的关系以及它们对宿主健康的影响。宏蛋白质组学的出现有助于弥合这一差距。
科技术可以告诉我们什么？
与Metagenomics和MetaTranscriptomics相比，Metaprootomics的主要优点是它基于“功能”信息，研究微生物群落的时空表征是有效的。借助于蛋白质序列的准确数据库，我们可以知道这些蛋白质属于和进一步了解社区不同成员的功能作用和相互作用的物种（或更高的分类群，如属植物等种类，如属植物等）。因此，元素组织已成为蛋白质组学研究的重要领域，以实现大规模蛋白质鉴定和对环境中的微生物种群的分析，例如人体肠道。
蛋白质是直接效应物，以保持细胞功能。蛋白质丰度的检测有助于解释分子水平的细胞表型信息。除了鉴定不同人工或自然环境中单个基因表达的变化之外，可以通过计算每个成员的生物质来分析群落结构的标准组织数据。由标准瘤产生的高分辨率质谱数据也可用于分析某些蛋白质和物种的同位素含量。
粪便样本元蛋白质组学分析的工作流程(Petriz等等。, 2017)
Metaprootomics研究
在进行元标题研究时，必须考虑以下四个步骤：1。有效地从整个微生物群落中提取蛋白质;2.除去可能干扰限制消化和质谱鉴定的化合物和试剂;3.去除宿主细胞和微生物细胞的富集;4.质谱前检测前样品的分类。
Creative Proteomics可以提供宏蛋白质组学服务，帮助您获取微生物区系结构和功能信息。
参考
Petriz，Bernardo A.和OctávioL.Franco。“富有术治疗健康和疾病的肠道微生物群的互补方法。”在化学5（2017）中的前沿：4。