在过去几年中,质谱(MS)在技术和应用中经历了壮观的开发。MS是产生气相分析物离子的技术,根据其质量与电荷比(M / Z)分离和检测这些离子。
如图1所示,质谱仪由三个主要组件组成,包括离子源,质量分析仪和检测器系统。在质谱实验中,分析过程序列在五个阶段工作,包括样品引入,分析物电离,质量分析,离子检测和数据处理。
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图1所示。质谱仪的组成及各组分的常用类型
串联质谱(MS/MS)将不同的质谱分析仪按顺序组合在一起,以增加通用性,并允许进行多个实验。串联质谱计可以进行多轮质谱分析,通常由某些形式的分子碎片分离。串联质谱的分子分裂方法有很多种。
样本介绍
虽然样品导入系统实际上不是质谱的一部分,但在保持高真空要求的同时,让样品进入离子源是很重要的。样品导入可能涉及单个样品或随后进行色谱分离。大多数现代质谱与高效液相色谱(HPLC)相结合,将液相色谱的物理分离能力与质谱的质谱分析能力相结合。此外,对于一些研究(如蛋白质组学),色谱分离可以提前进行分析。
分析物电离
在质谱分析中,电离指的是产生气相离子以使后续的质谱分析成为可能。电离技术是确定哪些类型的样品可以用质谱分析的关键。质谱中使用的电离方法多种多样,如根据被分析物分子的物理状态进行分类。传统的电离技术如电子电离(EI)和化学电离(CI)是气相电离技术,通常用于气相色谱-质谱(GC-MS)。另外,电喷雾电离(ESI)和基质辅助激光解吸电离(MALDI)等液相电离技术也被广泛应用于液相色谱-质谱(LC-MS)中。
批量分析
质量分析是质谱的心脏部分。在制备气相离子后,将它们传递到质量分析仪中并根据M / Z比分析。使用静态或动态场有各种类型的质量分析仪。每种分析仪都有其优缺点。
测量质量分析仪的性能存在一些重要的特征。质量范围通过质量分析仪确定离子测量的M / Z的极限。扫描速度是指通过分析仪在特定质量范围内测量的速率。质量精度是指M / Z的ration的测量误差与真正的m / z之间的差异。并且质量分辨是能够区分两个略微不同的m / z的峰。
离子检测
离子通过质谱仪后,被检测器检测并转化为可用的信号。探测器能够产生与入射离子丰度成正比的电流。因为在某一特定时刻离开质谱分析仪的离子数量一般很小,所以通常用放大法来获得可用的信号。有些探测器是用来一次计算单个质量的离子的,因此它们可以检测到所有离子在同一点的连续到达。其他类型的探测器(如照相板或图像电流探测器)可以计算多个质量,并检测所有离子同时沿着一个平面到达。
数据处理
由质谱仪获得的数据可用于定量分析,分子测定,结构阐明或序列测定。质谱可以产生各种类型的数据。作为M / Z比的相对丰度的曲线图的质谱是最常见的数据表示。并且对质谱的解释需要与数据库一样的各种技术的组合。在这里,我们收集一些可自由的访问数据库,可以帮助蛋白质组学和代谢组学中的数据处理。
表1.蛋白质组学和代谢组数据库
名称 | URL | 描述 |
---|---|---|
蛋白质组学数据库 | ||
uniprot. | www.uniprot.org. | 蛋白质序列及功能信息 |
GELBANK | gelbank.anl.gov | 生物体的二维凝胶电泳(2DE)蛋白质蛋白质凝胶图案 |
PDB. | www.rcsb.org/pdb. | 3D蛋白质的形状 |
EBI骄傲存档 | www.ebi.ac.uk/pride/archive. | 蛋白质组学数据存储库 |
GPMDB. | gpmdb.thegpm.org. | 全球蛋白质组机器数据库 |
代谢组合数据库 | ||
人类代谢组数据库(HMDB) | www.hmdb.ca | 人体中发现的小分子代谢物的详细信息 |
Kyoto基因和基因组的百科全书(Kegg) | www.kegg.jp | 整合基因组、化学和系统功能信息 |
Golm代谢组数据库(GMD) | gmd.mpimp-golm.mpg.de | 一个气相色谱-质谱(GC)对照库 |
Metil Metabolomics数据库 | metlin.scripps.edu/index.php. | 代谢物信息以及串联质谱数据 |
小分子途径数据库(SMPDB) | www.smpdb.ca. | 含有在人类中发现的小分子途径 |