在自上而下的蛋白质组学中,将ESI或MALDI生成的完整蛋白分子离子引入质谱分析仪,进行气相裂解。自顶向下的分析便于直接观察C端和n端以识别截断,并通过不同的序列区分一个亚型与另一个亚型。
与传统的Edman降解相比,创造性蛋白质组学可以提供这两种功能N端和c端测序服务,使用MALDI ISD质谱自上而下的策略。即使末端被修饰阻断,包括n端乙酰化、n端焦谷氨酸、序列截断和信号序列。这种分析也可以用于蛋白质降解和酶解的表征。
自顶向下的序列分析证实了完整蛋白的n端和c端均有20-80个残基。
Creative Proteomics还提供以下自上而下测序的生物信息学服务:
功能注释和充实分析
聚类分析
网络分析
统计分析
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