微生物聚糖微阵列分析


病原体的糖聚糖抗原本身代表了广泛的结构,其中包含了哺乳动物糖聚糖中不常见的各种单糖。因此,使用传统的聚糖微阵列方法对识别潜在病原体的宿主GBPs进行询问后,只能获得有限的信息。为了在各种病原体中提供更有代表性的复杂聚糖,最近的微阵列利用直接从已知微生物或合成微生物聚糖的阵列形式,生成微生物聚糖微阵列(MGM)。它由不同的和确定的微生物聚糖,以询问结合偏好和特异性的宿主免疫因子与碳水化合物结合活性。

微生物聚糖微阵列分析的一般策略与其他类型的微阵列类似。微生物聚糖可以从广泛的微生物中合成、分离和纯化,然后在微阵列格式中进行衍生和打印。它们被沉积在nhs激活的玻片上,浓度范围很宽,以促进最佳检测宿主-病原体相互作用。假定具有病原体识别活性的GBPs或血清与微阵列孵培养,以检测与微生物聚糖的潜在相互作用。检测通常是荧光与微阵列扫描仪。

微生物多糖微阵列图1所示。微生物聚糖微阵列原理图

MGM提供了结构不同的微生物聚糖的独特平台,以询问直接参与宿主病原体相互作用的宿主因子的特异性。它可以准确地预测宿主微生物相互作用,并且可以相当容易地评估碳水化合物结合蛋白,抗体甚至全细胞的结合特异性。MGM足够敏感,可以在特定微生物存在下拾取适应性免疫系统的这些变化。它还能够揭示一个完全新的先天免疫机制,用于抵抗尝试模仿哺乳动物自己细胞的不同细菌。

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