蛋白质识别服务
质谱支持蛋白质和多肽的鉴定,这将不需要更多繁琐的工作,耗时凝胶制备。Creative Proteomics长期专注于优化我们的质谱技术平台。我们开发了一个全面的蛋白质鉴定管道,从样品制备、蛋白分离纯化,到质谱分析,最后到系统的生物信息学分析。
下图说明了使用MS/MS方法进行蛋白质鉴定和表征的典型工作流程。起始点是一个给定的蛋白质样品,它可以是一个单一的蛋白质,也可以是不同蛋白质的复杂混合物。一种酶,通常是胰蛋白酶,用来将蛋白质消化成肽。在大多数情况下,一个或多个色谱阶段用于调节进入质谱仪的肽流。然后在质量分析的第一阶段一次选择一种肽。在质量分析的第二阶段,每个分离的肽通过碰撞被诱导成片段。捕获片段以合成MS/MS光谱。
随着年初的先进实验设备经验,创意蛋白质组学可以提供各种蛋白质组学服务,以协助您的科学研究,包括:
作为领先的组学分析服务提供商之一,创新蛋白质组学为我们的客户提供一系列的蛋白质鉴定服务。我们的服务保证准确可靠的结果,在快速周转时间!请随时联系我们,看看我们如何帮助解决您的问题。
+常见问题
- 可以分析哪种类型的样品?
任何含有蛋白质和肽的样品都可以进行分析,但是,所用的方法将取决于样品的类型和所需的结果。
创意蛋白质组学提供蛋白质和肽的分析及其后翻译修饰。
- 如何准备样品进行质谱分析?
蛋白质必须是凝胶带或冻干。聚偏氟乙烯膜上的蛋白质不能用质谱分析。斑点或条纹应染色(例如,用考马斯或MS兼容的银染色剂),然后切除。凝胶片应在微型离心管中风干。这样蛋白质就相对稳定,可以通过邮递/快递寄出。如果样品是纯的,并且在低盐缓冲液中,例如50毫米碳酸氢铵中;对于TRIS或磷酸盐缓冲液,最大盐强度为20mM。不存在NaCl和表面活性剂(如SDS)。装运前,样品必须在微型离心管中冷冻干燥或冻干。
注:样品表上必须注明缓冲液的类型和干燥前液体的体积。必须小心避免污染物污染凝胶。
- 质谱鉴定蛋白质是如何工作的?
将蛋白质用胰蛋白酶消化成肽,然后在质谱仪中单独分析每个肽并分析。通过使用吉祥物搜索算法将氨基酸断开氨基酸,将得到的碎片光谱与使用吉祥物搜索算法进行数据库来寻找相同的氨基酸序列来破坏每个肽。
该方法可以鉴定已知的蛋白质或密切相关的蛋白质。
注意:对于不能识别的样本!通过自动数据库分析eD是指De Novo测序。
- 质谱法鉴定蛋白质。
质谱是用于获得蛋白质序列信息的技术技术的状态,因为它是快速和成本效益的。
要鉴定1个蛋白质使用:使用MALDI-TOF / TOF(PMF + MS / MS)通过质谱法鉴定蛋白质鉴定。
鉴定1或2个低丰度蛋白使用:使用电喷雾LC / MS / MS质谱法通过质谱法鉴定蛋白质。
使用蛋白质组图谱(MuDPIT)1D-LC-MALDI鉴定10s(到>100)的蛋白质。
使用蛋白质组图谱(MuDPIT)2dlc-MALDI鉴定100s(到>1000)的蛋白质。
比较含有100岁(至> 1000)的蛋白质的两种(或更多)样品使用:差动前
通过iTRAQ分析(这同时提供鉴别和定量蛋白)。
- 我应该选择MALDI-TOF/TOF还是LC-MS/MS?
如果频段是Coomassie染色的:蛋白质鉴定通过质谱法(按MS / MS测序),并选择具有自动数据库分析的MALDI-TOF / TOF(PMF + MS / MS)质谱。这是最快,最具成本效益的方法,并且适用于Coomassie染色凝胶和2D凝胶斑。
如果带是银染色或可能含有多于一种蛋白质:蛋白质鉴定通过质谱法(由MS / MS测序),并选择电喷雾(LC / MS / MS)质谱与自动数据库分析。这是最敏感的方法。
- 知道要搜索哪个基因组数据库很重要吗?
通过将肽片段化模式与公共数据库中的序列匹配来实现蛋白质鉴定。这是人,小鼠,水稻,拟南芥,水果等的理想选择。如果样品来自与已知基因组高度相似的生物,则达到良好的结果。
*仅供研究使用。不用于诊断程序。
我们的客户服务代表每周7天,每天24小时工作。
询问