基于TMT的蛋白质组学服务


首先应用了Isobaric标签标记技术,用于通过Thompson等人同时鉴定和相对定量肽对的相对定量。2003年。Tandem Mass Tag(TMT)系统由Thermo Fisher Scientific设计用于不同种类样品中蛋白质的鉴定和定量。每个TMT标记试剂由胺反应性NHS-酯基,间隔物臂和MS / MS报告器组成。并且组内的等异标标签试剂具有相同的标称母体(前体)质量。这些报告离子位于MS / MS光谱的低质量区域中,用于报告可能不适合于代谢同位素标记策略的细胞基或组织样品中的表达变化,例如氧化镁。

等压标签TMT(串联质标记)有多达11个标签,几乎可以用于标记任何肽或蛋白质样品。TMT使多重分析成为可能,有效地利用仪器时间,并对技术变化进行进一步控制。由于TMT可以对多达11个样本进行多重检测,因此它被广泛用于蛋白质生物标志物的定量发现。TMTzero、TMTduplex、TMTsixplex、TMT10plex和TMT11plex reagent具有相同的结构,允许从方法开发到多路定量的有效过渡。

基于TMT的蛋白质组学服务图1. TMT工作流程

通过测量在肽碎片期间测量从串联MS模式(MS2)中的标签中释放的片段报告离子的强度进行TMT定量。在全扫描模式(MS1)中选择前体离子以进行碎片化。由于离子选择步骤降低了噪声水平,因此有利的。理想地,在前体离子碎片期间只有一个选定的前体离子碎裂。然而,常常在特定的M / Z窗口内捕获其他前体离子,并在实践中与所选前体一起碎片化。这是前体共同隔离或混合。Isobaric标签最佳地用质谱仪,允许MS3级定量,例如Thermo的融合丁腈。附加滤波步骤允许几乎完全校正由MS1前体的污染引起的共隔离校正。

仪器

Thermo Scientific™orbitrap Fusion™Lumos™Tribrid™质谱仪,与其他仪器相比,提供最准确的定量和最多的蛋白质标识。

样品准备

样品制备很容易。只需发送冷冻细胞或组织样本,我们的团队将休息。每样品约100μg总蛋白质足够。

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