绝对量化(水)


绝对量化(水)

绝对定量是一种有针对性的定量蛋白质组学技术,表现出强大的疗效,并被越来越多地用于各种各样的定量蛋白质组学研究。AQUA策略是蛋白质及其修饰状态的绝对定量(AQUA)。肽合成与稳定的同位素作为理想的内标准,以模拟天然肽形成的蛋白质水解。这些合成肽也可以通过共价修饰(例如,磷酸化,甲基化,乙酰化等)制备,这些修饰在化学上与自然发生的相同转译后的修改.通过在串联质谱仪中使用选定的反应监测分析,AQUA内标肽可以精确、定量地测量蛋白质和蛋白质水解后翻译后修饰的蛋白质的绝对水平。

生物质谱技术的发展导致了对蛋白质进行大规模定量的多种策略的发展 细胞内的压力水平。除了蛋白质的测量 在蛋白质组学中,绝对定量是一种有用的方法。

绝对定量策略:蛋白质定量和翻译后修饰的一般步骤。AQUA通过使用含有稳定同位素的合成肽提供绝对定量。

绝对定量方法是基于发现MS信号响应和蛋白质浓度之间的意外关系:每摩尔蛋白质中三个最强的胰蛋白酶肽的平均MS信号响应是恒定的,变异系数小于10%。给定一个内部标准,该关系用于计算通用信号响应因子。通用信号响应因子(计数/mol)显示为相同的所有蛋白质测试。

同位素法只能建立表达蛋白的相对定量,而绝对定量(AQUA)策略可以为精确测定表达蛋白提供信息 压缩和翻译后修饰水平。AQUA方法依赖于使用合成内标准肽,在消化过程中以已知浓度引入细胞裂解物。通过选择反应监测(SRM)实验在串联质谱中分析蛋白水解样品,结果直接检测和定量的天然肽和同位素标记AQUA内标肽。

该方法的简单性和灵敏度,加上串联质谱仪的广泛应用,使AQUA策略成为直接从细胞裂解液中测量蛋白质水平和翻译后修饰的一个非常有用的程序。

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