n -糖基化位点占据是糖蛋白的生理特征,主要贡献n -糖基化位点。n -糖基化位点占据的程度本身与疾病的严重程度相关。质谱(MS)已广泛应用于复杂或临床样本的现场分析。在质谱技术的基础上,无标法和标记法在这一领域得到了广泛的应用。标记方法包括SILAC(细胞培养中氨基酸稳定同位素标记)、TMT(串联质量标记)、二甲基化和iTRAQ(绝对和相对定量等压标记)。无标记方法在样品制备方面具有实验简单的优点。
图1所示。基于ms的标记和无标记技术用于定量n -糖基化位点占据(Zhang等, 2017)。
研究位点特异性n -糖基化包括n -糖基化位点占据和位点特异性聚糖结构对理解糖蛋白的生物合成和功能具有重要意义。n -糖基化位点的定量研究对疾病研究和药物开发也很重要,因为n -糖基化位点的占据可能是生理的,受人类疾病的影响或被异源蛋白过表达所修饰。在Creative Proteomics,我们提供标记和无标记技术来定量n -糖基化位点占据。
标记方法的显著优点是能够在一次运行中同时有效地分析差异标记的样品。我们可以提供胰蛋白酶催化18O, SILAC和iTRAQ标记方法用于n -糖基化位点占用分析。同位素编码糖基化位点特异性标记(IGOT)可用于大规模的n -糖基化位点占用分析。
n -糖基化位点占据的无标记定量一般是基于肽离子强度或峰面积。其显著的优点是工作流程简单。糖蛋白中可变n -糖基化位点占据分析的一般策略包括以下步骤。
图2。n -聚糖位点占用率的无标记定量工作流程。
我们使用一系列的样本来源如下。
创造性蛋白质组学提供了n -链聚糖位点占据分析,以获得在许多潜在的n -糖基化位点的整个混合物中真正的糖基化肽,这些位点可能是糖基化的,也可能不是。请随时联系我们讨论您的项目。
参考文献
1.苏玉玲,王斌,胡明德,等.草鱼血清IgM位点特异性n -聚糖特征分析。免疫学前沿2018 9。
2.Thannhauser T W, Shen M, Sherwood R,等.番茄细胞壁N - linked糖蛋白的大规模经验鉴定流程(茄属植物lycopersicum)水果的串联质谱。电泳, 2013, 34(16): 2417-2431。
3.张硕,李伟,陆华,等.基于标记/无标记策略的n -糖基化位点占据状态的LC-MS/MS定量。Talanta, 2017, 170: 509-513。