简单介绍蛋白乙酰化的介绍

乙酰化是指将一个乙酰官能团引入化合物中的反应,其中一个羟基的氢原子被一个乙酰基(CH3 CO)取代,生成一种特定的酯,醋酸酯。蛋白质乙酰化通常有两种不同的形式。在人类中,几乎(80%-90%)蛋白质在其新生多肽链的n α末端发生共翻译乙酰化。另一种类型是赖氨酸残基乙酰化。

Brief-introduction-of-Protein-acetylation-1

氨基乙酰化作用

n端(Nt)乙酰化是由Nt-乙酰基转移酶(NATs)催化的,迄今为止发现是不可逆的。NATs是一种由一个催化亚基和至多两个辅助亚基组成的单或多亚基酶,可以将乙酰基从乙酰辅酶a (Ac-CoA)转移到蛋白质第一个氨基酸残基的α-氨基。在NATs中,主要辅助亚基调节催化亚基的活性和底物特异性。不同的nat负责Nt的乙酰化。在人类中,目前已经发现了6种natt,包括NatA、NatB、NatC、NatD、NatE和NatF。除了亚基组成的不同,各种nat的底物特异性也不同。

NT乙酰化起着分子效应不同的角色。首先,NT-乙酰确定用于某些蛋白质的亚细胞定位。例如,ARL3和Grh1,二高尔基体相关蛋白,不能准缺失Nt个乙酰基团时高尔基体。其次,据报道,N-叔乙酰性约束的蛋白在胞质溶胶中并抑制翻译后易位迁移到内质网(ER)和分泌途径。此外,NT乙酰化可以改变N-末端的属性,以使蛋白质 - 蛋白质相互作用成为调制。它显示了几种蛋白质他们的合作伙伴的结合亲和力是Nt个乙酰化后增加。例如,所述的E2泛素结合酶Ubc12经历由Nt个NATC乙酰化使朝向其相互作用伴侣,E3泛素连接酶DCN1的亲和性增加。此外,NT-乙酰化对照蛋白质量和寿命,并调节由N端法则途径蛋白质的化学计量。

n端乙酰化具有多种生理功能。nat对骨骼和血管的正常发育至关重要。n端乙酰化可以调节血压、蛋白酶体定位、激素以及细胞器的结构和功能。在人类疾病中,它与神经退行性疾病(如阿尔茨海默病、帕金森病、路易体痴呆)和癌症(如肺癌、乳腺癌、结直肠癌)有关。

乙酰化赖氨酸

乙酰化赖氨酸残基最早发现于调控基因转录的组蛋白中。但是赖氨酸乙酰化并不局限于组蛋白。与Nt乙酰化不同,赖氨酸乙酰化是可逆的。乙酰化由赖氨酸乙酰转移酶(KATs)催化,赖氨酸去乙酰化由赖氨酸去乙酰化酶(kdac)催化。

据报道,年龄生活在人类基因组- 22已确定基因kat (kat的确切数字是有争议的),可以分为三个不同的家庭,包括GCN5(一般控制non-derepressible 5)有关的乙酰转移酶(蚊)家族,神秘岛家族和p300 / CBP (CREB-binding蛋白质)的家庭。已知的KAT复合物底物不仅包括组蛋白,还包括一些不同的转录因子、转录共调节因子以及一些特定的细胞信号通路蛋白,如p53、β-catenin、NF-κB、MyoD或Rb。甚至一些RNA分子也会被乙酰化。有四种不同类型的kdac,包括I、II、III和IV类。I、II和IV类是依赖Zn2 +的酰胺水解酶,而III类(也称为sirtuins)使用NAD+作为共底物,因为它的催化活性是Zn2 +端依赖酰胺水解酶。

组蛋白是首次发现乙酰化蛋白质。组蛋白分子通过不同翻译后修饰,包括磷酸化,甲基化,乙酰化和改性。组蛋白乙酰化,确定DNA组蛋白相互作用的组蛋白组装以及折叠和紧凑性,并因此呈现许可和压制性染色质结构之间的开关。除了组蛋白,KATS可以促进细胞骨架蛋白。还有其他一些蛋白质的新标识乙酰化网站,包括HMG蛋白,c-Myc的,雌激素和雄激素受体,E2F / Rb和等。

赖氨酸乙酰化的生理作用已有报道。组蛋白与几乎所有类型的dna模板过程紧密调控相关,如转录、复制、重组、修复以及翻译和特殊染色质结构的形成。因此,蛋白质赖氨酸乙酰化影响一系列的细胞信号通路以及代谢、应激反应、凋亡和膜运输。

Brief-introduction-of-Protein-acetylation-2

有许多可用于识别乙酰化赖氨酸相对较少的工具。随着质谱的发展,它一直是乙酰化赖氨酸的定性和定量分析的重要工具。为了分析组蛋白赖氨酸乙酰化,有几个步骤,包括细胞裂解物,组蛋白提取,组蛋白分离,质谱,和数据分析。用于分析来自全细胞蛋白的乙酰化的赖氨酸的步骤包括细胞裂解物,蛋白质分离,赖氨酸乙酰化肽的富集,赖氨酸乙酰化的肽的分离,质谱法,和数据分析。


参考:

  1. Drazic, Adrian等。"蛋白质乙酰化的世界"生物化学与生物物理学报-蛋白质与蛋白质组学1864.10(2016):1372至1401年。
  2. 张楷,杉杉田和范Enguo。“蛋白质乙酰化赖氨酸分析:当前基于MS的蛋白质组学技术。”分析师138.6(2013):1628至1636年。

发表评论

您的电子邮件地址将不会被公布。必填字段已标记