随着生物化学的发展，质谱技术也在不断改进和创新，包括各种软电离技术，如快速原子轰击(FAB)、场解吸电离(FD)、二次离子质谱(SIMS)、等离子体解吸(PD)、激光解吸(LD)、电喷雾电离(ESI)，热喷涂(TSI)，以及基质辅助激光解吸电离(MALDI)等。其中ESI和MALDI是目前应用最广泛的两种技术。
在20世纪80年代，芬恩首次开发了一种新的样品电离技术，该技术使用带有高压电场(通常为4000电子伏)的金属注射器。样品溶液通过高压注射器产生带电液滴，送入电离室。在进入分离室进行分析之前，电离室中的干热气体将这些带电液滴蒸发，并将它们分解成带有一个或几个电荷的大量离子。这种电离技术的主要特点是当样品分子被电离时，整个分子的完整性得以保留而不产生碎片离子。因此，它可以用于蛋白质、核酸等生物大分子的分析。由于在电离过程中样品溶液中会形成带电液滴，因此这种电离技术被称为ESI技术。
电喷雾质谱采用液体进样，可与高效液相色谱、毛细管电泳等高效分离方法相结合，更好地分析复杂样品。
20世纪80年代末，海伦坎普和卡拉斯等．提出了另一种电离技术，MALDI技术。它将样品和基质(通常是有机酸)按一定比例混合，并将混合物放在探针上。在脉冲激光的照射下，样品分子和基体分子同时吸收激光的能量并汽化。蒸发后的基质分子可以很容易地释放出质子，然后被样品分子捕获，这样样品分子就带正电了。带电的样品分子将在强电场的作用下加速进入飞行管进行分析。
MALDI技术的原理是用脉冲激光电离基质分子，同时汽化样品分子。在气相中，基质分子将质子转移到样品分子中，使样品分子带电，为质谱分析做好准备。基质吸收了激光的大部分能量，避免了激光破坏样品分子而只生成准分子离子。此外，脉冲激光可以作为一种电离方法，减少激光与样品分子的相互作用时间，降低相互作用温度，避免样品分子的热分解。因此，MALDI质谱法也可用于生物大分子的分析。
与早期质谱的硬电离方法相比，ESI和MALDI等软电离技术对样品分子的破坏较小，能够保持整个分子的完整性。
引用:
1.芬恩J B，曼恩M，孟C K，等．大生物分子的电喷雾电离质谱分析。地球科学进展，2019,36(4):531 - 534。
2.海伦坎普F，卡拉斯M，比维斯R C，等．生物聚合物基质辅助激光解吸/电离质谱分析。分析化学，1991,63(24):1193A-1203A。