代谢组学创造性的蛋白质组学

创造性的蛋白质组学代谢组学

Keratan硫酸盐分析服务

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创意蛋白质组学,作为生物科技产业的领导者,致力于用先进的仪器和专业研究团队锻造高质量的目标代谢组服务。我们提供高吞吐量,高精度和短耗时的角抗硫酸盐分析服务,可以满足客户的所有需求,以协助您的科学研究。

概述

糖胺聚糖(GAGs),又称粘多糖,是一种带负电荷的多糖,由重复的双糖单元组成。它们存在于每一个哺乳动物组织中,并包含由其分子结构决定的广泛功能。历史上,GAG的功能被认为局限于细胞水合作用和结构支架。然而,最近的证据表明,GAG也在细胞信号传导中起着关键作用,调节着广泛的生化过程。根据其核心双糖单位,将GAG分为四大类,包括肝素/硫酸肝素、硫酸软骨素、硫酸皮肤素、透明质酸和硫酸角蛋白。其中,keratan sulfate (KS)是唯一一种以半乳糖为结构成分的GAG类型。

糖胺聚糖的主要重复单位。组成单糖的颜色编码符合SNFG术语。缩写如下:Glc代表葡萄糖,Ido代表半乳糖,Gal代表半乳糖,N代表胺,S代表硫酸盐,A代表酸,NAc代表N-乙酰。图1.糖胺聚糖的主要重复单元。组成单糖的颜色编码符合SNFG术语。缩写如下:Glc代表葡萄糖,Ido代表半乳糖,Gal代表半乳糖,N代表胺,S代表硫酸盐,A代表酸,NAc代表N-乙酰。

基于组织特异性,最重要的是基于化学结构,定义了三类Ks,这根据硫化程度,硫酸化图案和结合Keratan硫酸核与核心蛋白结合的连接的寡糖的类型而变化。形式I KS是一种具有可变硫化(非硫酸盐,单硫酸盐和二硫酸盐)的N链KS链,主要存在于角膜中。II型Ks是几乎完全硫酸化的KS链,其通过Galnac连接到核心蛋白O型,主要存在于软骨组织中。KS型III也高度硫酸化,但通过2-O-甘露糖键连接到其核心蛋白质,是中枢神经系统中最丰富的核心蛋白质。

优势

  • 短暂耗时
  • 灵敏度高,检测限制少
  • 精度高,重复性好
  • 高吞吐量
  • 定制的服务

服务工作流程

  • 从细胞膜或血清中提取纯化鞘脂糖
  • 用葡萄糖苷酶释放鞘脂糖
  • 糖的全部甲基化
  • 基于2-AB标记的UPLC-HILIC-FLD分析
  • 飞行时间质谱分析完全甲基化聚糖

基于发现的蛋白质组学工作流程。图2所示。基于发现的蛋白质组学工作流程。

样品的要求

  • 血清/血浆:500μl /样品
  • 必须避免反复冻融样品。血清标本在室温下在收集管中沉淀30分钟,然后运至离心管,8000转/分离心5分钟。离心后将上清均匀分成500ul /试样的冷冻管。

  • 蛋白质:100µg
  • 抗凝血(EDTA): 1ml
  • 在收集后必须立即添加抗凝血剂和防腐剂,然后在-80°C下冷冻。

  • 尿液:1 ml /样品
  • 尿液样品应同等分为每管1mL的离心管,每根管加入1/100(w / v)叠氮化钠并储存在-80℃。

  • 动物组织:200毫克/样品
  • 应立即在液氮中冷冻样品,然后在收集后运输至-80℃以进行储存。

  • 细胞数:≥1 × 107/样本
  • 细胞活性应立即终止,以保持细胞的完整性。

  • 粪便:500毫克/样品

一般来说,为了保证有足够的样品来完成整个项目,需要尽可能多的提供单个样品的体积。剩余样品将免费保存一年,并在必要时随时退还。所有样品都需要在-80°C下储存和运输,尽量避免使用表面活性剂(SDS、Triton-X)和无机盐。

单组重复临床样本不少于30例。

单组动物标本重复不少于9例。

报告交付

  • 实验程序(中英文)
  • 仪器相关参数(中英文)
  • 用于鉴别物质的定量或定量信息
  • 质谱数据
  • 原始数据文件和详细的摘要报告

服务周期

  • 样品检测:5-10个工作日
  • 数据分析:5-10个工作日

创新蛋白质组代谢分析平台致力于为多种靶物质提供全方位、可靠、准确的分析服务,适用于生命科学研究、药物探索、生物学测定等领域。我们真诚希望与您合作,协助您的科研工作。

参考资料

  1. 王伟,石磊,秦勇,等。硫酸软骨素/硫酸皮聚糖降解酶的研究与应用。生物医学工程学报,2018,35(4):560442。
  2. Z. Wang,K. Arnold,Y.Xu,等。同位素标记的校准剂的硫酸乙酰肝素的定量分析。Commence Biol,2020,3(1):425。

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