代谢组学创造性的蛋白质组学

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植物代谢组学服务

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凭借数十年的经验,Creative Proteomics致力于为学术界和工业界提供可靠和高性价比的植物代谢组学服务。我们的解决方案包括植物非靶向代谢组学服务,植物非靶向脂质组学服务,以及植物靶向代谢组学服务将满足您的具体项目要求,从取样到生物信息学。

概述

植物产生多样化的结构和丰富的代谢物,在植物生长,发展和对环境的反应中起重要作用。植物代谢组学是植物组织内代谢物的大规模研究,从代谢物反映了生物活性的终点,促进了对植物生理学和生物学的理解。植物代谢组学还提供了一种在正常和压力条件下改善植物行为的工具。植物代谢组学的方法和仪表已经迅速发展。一系列综合技术,例如核磁共振光谱(NMR),质谱(MS),包括气相色谱-SMS(GC-MS)和液相色谱-SMS(LC-MS)和毛细管电泳-SMS(CE-MS)和傅里叶变换离子回旋谐振 - MS(FI-ICR-MS)使我们能够对植物细胞的化学品库存进行全面和无偏的分析。多重反应监测(MRM)通常用于特定化合物的离子的特定靶向。代谢组科策略可分为未明确的和有针对性的方法:(1)未明确的代谢组学是对样品中所有可测量化合物的全局分析;(2)靶向代谢组科是测量靶向化学表征和生物化学注释代谢物。未甲状腺分析可以检测新的代谢物并涵盖样品中的所有可测量分析物,而目标代谢组合提供更准确的特征和定量分析。

植物代谢组学的应用

  • 揭示基因在植物基因组中的功能
  • 了解植物在正常或逆境条件下发育的分子机制。
  • 转基因作物的安全评估
  • 作物改良
  • 目标代谢工程

植物代谢组科分析方法

创新蛋白质组学为不同的植物代谢组学应用提供了几种方法。

诸多代谢组学服务 没有针对性Lipidomics服务 目标代谢组服务
非靶向代谢组学允许在一次运行中研究多达数千个代谢物的代谢表型。它能够对所有代谢物进行无偏性筛选,但会导致更复杂的数据步骤。 植物脂质组学采用基于质谱的方法分析植物细胞脂质。非靶向植物脂质组学可用于检测植物发育和环境变化引起的代谢变化。 植物靶向代谢组学为植物靶向代谢产物的鉴定和定量分析提供了一种高分辨率的工具,以客观和具体的方式测量其对环境和遗传变化的响应。

仪表

Creative Proteomics采用最先进的LC-MS/MS和GC-MS/MS系统进行植物代谢组学研究。

我们的主要工具包括:

  • 液相色谱系统
  • Orbitrap女士
  • 三重Quad-MS
  • Q-TOF-MS
  • 气相

植物代谢组学服务

数据分析

  • 参数和非参数单位变量统计检验:t检验、方差分析、
  • 主成分分析(PCA)。
  • 聚类分析:层次聚类分析,K-means,
  • 建模算法
  • 将代谢组学数据与转录组学、蛋白质组学和表型组学研究相结合

Creative Proteomics提供了几种研究植物代谢组学的方法,并提供精确和详细的数据和分析报告。我们还可以与我们的合作者一起自定义方法或建立新方法,以满足任何项目的特定需求。

参考

  1. 洪俊,杨玲,张东,.植物代谢组学:植物科学不可或缺的系统生物学工具。国际分子科学杂志, 2016, 17(6): 767。
  2. 植物代谢组学:农业生物技术的应用与机遇,植物生物技术与农业.学术出版社,2012:67-81。
  3. Roberts L D, Souza A L, Gerszten R E,.有针对性的代谢组学。分子生物学的当前协议, 2012, 98(1): 30.2。1 - 30.2。24.
  4. de Souza L P, Alseekh S, Naake T,.基于质谱的非靶向植物代谢组学。植物生物学的当前协议2019年,4(4)。

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