代谢组学创造性的蛋白质组学

创造性的蛋白质组学代谢组学

粘蛋白类型o聚糖分析服务

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Creative Proteomics是一家领先的生物技术公司,提供基于动物样本的粘蛋白型o -聚糖分析服务。创新蛋白质组学检测平台依托先进的质谱技术和经验丰富的研究团队,为您的科研提供高质量、快速、准确的一站式检测服务。

概述

蛋白质糖基化是一种重要的翻译后修饰。对蛋白质糖基化的研究有助于解释蛋白质的多种功能及其在许多生理和病理过程中的重要作用。细胞膜表面蛋白和分泌蛋白的糖基化主要包括o型糖基化和n型糖基化。目前对粘蛋白型o -糖基化在体内的生物学功能知之甚少,因此对粘蛋白型o -糖基化生理功能的研究较少在活的有机体内及其与疾病的相关性将是未来糖代谢组学研究的重点。

o -粘蛋白糖基化主要有两种核心类型:基于core1的core1和core2亚型和基于core3和core4亚型,分别受core1半乳糖基转移酶(T-synthase)和核心β1,3- glcnac -转移酶(C3GnT)调控。Core1和core2亚型是o型聚糖的主要类型,主要表达于血管内皮细胞、上皮细胞和造血细胞。core3和core4亚型主要在肠上皮细胞中表达。

粘蛋白上常见的o -聚糖核心结构。图1所示。粘蛋白上常见的o -聚糖核心结构。

优势

  • 短时间
  • 灵敏度高,检测限制少
  • 精度高,重复性好
  • 高吞吐量
  • 定制的服务

实验过程

邻聚糖修饰分析是识别聚糖结合位点的有效方法。其原理是在天然多糖的各个游离羟基上引入稳定的取代基,然后酸水解分解稳定性比醚弱得多的糖苷键。结果,在先前引入的连接位点上产生了一个带有自由羟基的甲基化单糖。部分甲基化单糖与还原剂(通常是氘化硼)一起打开,引入新的羟基(可能是Cmur1处的氘原子),这有助于识别单糖的还原端。然后将所有游离羟基乙酰化,形成部分甲基化部分甲基化醋酸糖醇酯(PMAA),用于后续分析。

服务工作流程

将o -糖蛋白水解得到粘蛋白型的o -糖蛋白,用荧光标记,然后与不同的糖苷酶分步反应。各反应产物经亲水色谱分离,荧光检测器和质谱仪检测。

基于质谱的糖蛋白组学在不同复杂生物样品中的典型工作流程。图2所示。基于质谱的糖蛋白组学在不同复杂生物样品中的典型工作流程。

样品的要求

  • 血清/血浆:500μl /样品。
  • 必须避免反复冻融样品。血清标本在室温下在收集管中沉淀30分钟,然后运至离心管,8000转/分离心5分钟。离心后将上清均匀分成500ul /试样的冷冻管。

  • 蛋白质:100µg
  • 抗凝血(EDTA): 1ml。
  • 采集后必须立即加入抗凝剂和防腐剂,然后在-80°C下冷冻。

  • 尿液:1 ml /样品。
  • 尿液样本应均匀分成离心管,每管1ml,每管加入1/100 (w/v)叠氮化钠,-80℃保存。

  • 动物组织:200毫克/样品。
  • 样品采集后应立即用液氮冷冻,并运至-80℃保存。

  • 细胞数:≥1 × 107/样品。
  • 细胞活性应立即终止,以保持细胞的完整性。

  • 粪便:500毫克/样品

一般来说,为了保证有足够的样品来完成整个项目,需要尽可能多的提供单个样品的体积。剩余样品将免费保存一年,并在必要时随时退还。所有样品都需要在-80°C下储存和运输,尽量避免使用表面活性剂(SDS、Triton-X)和无机盐。

单组重复临床样本不少于30例。

单组动物标本重复不少于9例。

报告交付

  • 实验程序(中英文)
  • 仪器相关参数(中英文)
  • 用于鉴别物质的定量或定量信息
  • 质谱数据
  • 原始数据文件和详细的总结报告

服务周期

  • 样品检测:5-10个工作日
  • 数据分析:5-10个工作日

创新蛋白质组代谢分析平台致力于为多种靶物质提供全方位、可靠、准确的分析服务,适用于生命科学研究、药物探索、生物学测定等领域。我们真诚希望与您合作,协助您的科研工作。

参考文献

  1. Guzman-Aranguez, p . Argueso。眼表粘蛋白型o -聚糖的结构和生物学作用。岩石力学与工程学报,2016,35(1):1 - 8。
  2. Brockhausen, H. Schachter, P. Stanley, O-GalNAc Glycans,《糖生物学实质》,nd,等,编辑,冷泉港(纽约)。2009.
  3. 陈志强,黄杰,李磊。基于质谱(MS)的复杂生物样品糖蛋白组学研究进展。趋势分析化学,2019,118:880-892。

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