总结
蛋白质测序主要依靠化学或酶解方法分离多肽,检测氨基酸残基的数量和组成。这篇文章将介绍蛋白质测序的原理和实验步骤。
定义
目前所谓的蛋白质测序是指对蛋白质一级结构的检测,一级结构包含蛋白质中多肽链的数量。多肽和蛋白质在许多情况下可以同等地使用。多肽的氨基酸序列是蛋白质的生物学功能。
测序步骤
1.分裂多肽链
蛋白质分子应分离纯化。几种多肽通过非共价键结合在一起,称为低聚蛋白。为例。8 mol/L尿素或6mol /L盐酸胍可用于处理四聚体-Hb和二聚体-烯醇化酶。
2.检测蛋白质分子中多肽的数量
通过检测氨基酸残基的摩尔数与蛋白质分子量之间的关系,可以确定多肽的数量。
3.二硫键断裂
几个多肽链由二硫键连接。在8mol / L尿素或6mol / L胍盐酸盐条件下,过量的&[-]-巯基乙醇将二硫键还原为硫醇。然后它应该被烷基试剂保护以防再氧化。
裂解和保护二硫键
A.performic酸:-CH2SO3H
b .还原+氧化:巯基乙醇,DTT +碘乙酸,-S-CH2-COOH
c .亚硫酸分解:-R1-S- s - r2 + HSO3-, R1-S- + R2-S-SOH3
4.检测多肽链的氨基酸组成,计算氨基酸组成的分子比。
多肽的氨基酸分为氨基端和羧基端两类。在肽链氨基酸序列分析中,n端比c端重要得多。
6.多肽可以分裂成几个小肽。可以使用两种以上的方法将肽样品分成两组或两组以上的肽或肽片段,然后进行分离。
7.确定每个肽段的氨基酸序列
8.确定多肽链中多肽片段的序列
9.确定原多肽链中二硫键的位置
通常,胃蛋白酶会用来处理那些带有二硫键的多肽链。然后使用2d电泳技术分离每个肽片段。分析可能含有二硫键的肽片段的组成和序列。然后将其与其他肽段进行比较,通过其他方法分析,确定二硫键的位置。
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