微生物组被称为另一个器官或有时被称为我们的第二基因组,微生物组基因的数量是人类基因的100多倍,仅在肠道中就有超过300万个细菌基因。肠道中超过99%的细菌是厌氧菌,其中许多还没有被彻底研究过,因为它们不能在宿主之外培养。下一代测序技术的出现为分析人类肠道微生物多样性开辟了新途径。16S rRNA、18S rRNA和ITS是最常用的测序扩增子,用于分析特定基因组区域的遗传变异,用于识别和分析肠道微生物,包括细菌、古菌和真菌,目的了解人体肠道微生物群的动态和稳定性,阐明其在疾病诊断、治疗和预防中的重要作用。
核糖体RNA是占细胞RNA 80%左右的主要RNA形式,它由多个保守和可变区域组成,便于扩增和序列可区分,便于微生物鉴定和比较,最常用的片段分布在16S、18S和ITS内。
16 s rRNA测序:16S测序广泛用于细菌系统发育和分类学研究,特别是在不同的偏心神经样本中。它也被用于将细菌重新分类为全新的物种或属,甚至描述从未成功培养的新物种。
18 s rRNA测序18S RNAs是真核生物细胞质小组分的结构性rna,是原核生物和线粒体中16S核糖体rna的同源物。18S rRNA基因序列数据被广泛应用于重建真核生物进化史的分子分析中。
其测序:内部转录的间隔物(其)位于细菌和古亚的16s和23s rRNA基因之间,而真核生物基因中有两种ITS1和ITS2,位于5.8s rRNA基因的每一侧。ITS1是其在细菌和古痤疮中的同源物。它是真菌分子生态学中最广泛测序的DNA区域,其通常用于在属甚至种类水平的分子系统中。
样品需求
感兴趣的区域 | 样本类型 | 浓度 | 最小体积 |
16S. | 基因组DNA / 主要PCR产品 |
1 ng /µl最低 | 10µl |
18岁 | 基因组DNA / 主要PCR产品 |
1 ng /µl最低 | 10µl |
它的 | 基因组DNA / 主要PCR产品 |
1 ng /µl最低 | 10µl |
我们的优势
◆高覆盖,高灵敏度
◆宽读范围
◆经济高效,快速的周转时间
◆生物信息学支持
◆专业从事肠道微生物群分析
创意蛋白质组学提供16 s / 18 s /其扩增子与高精度高深度测序服务,满足学习的需求群体遗传学和微生物配置文件覆盖的范围细菌、古菌和真菌在胃肠道中发现,为了研究生物多样性在和这些微生物和人体之间的交互。我们的16S/18S/ITS测序服务使用寡核苷酸探针来定位和捕获感兴趣的区域——通常是保守基因的高可变区域或基因间区域,其次是下一代测序,通过与微生物数据库和生物信息分析进行比较,以达到高效的遗传变异识别和表征的目标。如果您对我们的amplicon测序服务感兴趣,并想了解更多,请随时访问联系我们!
*只供研究用途。不用于诊断程序。