对肠道菌群的研究在很大程度上受到高通量测序技术的推动,不再需要克隆步骤,可以获得更高产量的测序数据。猎枪宏基因组测序(或全基因组猎枪测序,WGSS),在不选择性富集特定人群的情况下,对数十亿对DNA碱基对进行一次测序,不仅能够分析微生物群落组成和多样性,而且还为理解肠道微生物基因组编码的功能提供信息。散纳宏基因组测序从基因上分析来自肠道群落中不同类型微生物的DNA,以了解目前存在的微生物及其生理特性。例如,散弹宏基因组学的使用可以揭示肠道细菌中的抗生素基因,或者在某些患者中复制一些特定的、统计上有意义的基因、模块和途径,揭示个体之间、健康状态和疾病状态之间的群体结构差异,最后可能会导致对病原体的理解和治疗,以及调整肠道菌群组成的进展。
图1. Metagenomics工作流程摘要(2017年Quince)
创造性的蛋白质组学,通过圆形肠道植物群平台,提供一站式霰弹枪的服务,为您的研究提供一站式霰弹枪群平台,为肠道微生物群进行研究,如宿主病原体相互作用,细菌疾病机制以及微生物疾病如何相互作用.
简要介绍我们的散弹宏基因组测序服务:
- 样品收集和DNA提取
- 图书馆准备
- 高通量测序
- Metagenome组装
- 叠连群装箱
- 后处理的数据分析
- 独立的验证
数据分析包括但不限于:
- 排序数据输出统计信息
- 子类型/聚类分析
- 多样性分析
- 物种分类和丰度分析
- 系统重建
创造性的蛋白质组学可以为您提供完整的生物信息学服务,生物标志物发现和预测建模使用统计和机器学习。我们的定制分析将保证您的研究的高质量,并为您的研究提供更多的闪光的想法。想了解更多关于猎枪宏基因组测序的肠道微生物群研究,请随时访问联系我们.我们将根据您的项目安排有经验的科学家为您提供宏基因组研究的专业建议和可选服务。品质、专业、卓越是我们永恒的追求。期待与您的合作,在肠道菌群研究方面取得新的进展。
参考
1贴梗海棠C;等.霰弹宏基因组学,从取样到分析。自然生物技术.2017年,35(9):833 - 44。
*只供研究用途。不用于诊断程序。
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