寡核苷酸微阵列是DNA微阵列,其探针在选择对应于20-100nts区域的外显子的基因后合成寡核苷酸DNA分子,其中吲哚(通常25-60mer)表示代表单个基因或基因均匀的基因- 直接印刷到阵列表面上。已经使用寡核苷酸微阵列通过分子杂交来鉴定大量的特异性DNA标志物。可以根据所需的目的设计序列的长度 - 更长的探针更具体地对单个靶基因更具体;较短的探针可以在阵列上更高的密度被发现,并更便宜到制造。由于探针短于cDNA微阵列的特异性,因此可以抑制其特异性,并且可以抑制交叉杂交。
寡核苷酸微阵列使得灵活定义受控和精心设计的杂交平台。寡核苷酸微阵列的主要优点是在单一测试中检测多个和新的病原体(原核,真核生物,病毒)。在此之上,寡核苷酸阵列提供绝对量能力,并提供更大的敏感性和特异性,可以区分单一核苷酸多态性(SNP)和剪接变体。寡核苷酸微阵列平台的其他优点包括标准化芯片生产和处理,降低了各种反应所需的可变性的有限RNA量,以及用于样本分析的软件程序的可用性,以便以鲁棒性和可靠性提供结果。
图1. cDNA和寡核苷酸微阵列的基本步骤(Latif 2010)
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参考
1 shuaib l;丹尼尔G.基因组在发展中的患病中分析。心脏发育和再生。2010年。
*仅供研究使用。不适用于诊断程序。
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