各种微生物,包括细菌,病毒和微生物真核生物,特别是不同年龄组,饮食习惯和健康问题,殖民化人胃肠道。肠道微生物肿块对人类健康和健身至关重要。无论代理研究都提供了大量有用的信息,不能在特定环境因素下分析蛋白质表达的情况下彻底分析细菌种类。蛋白质组织是一种生物学的分支,其使用各种蛋白质组学,基因组学和转录组科,以协助肽勘探和分类。蛋白素学MOMICS是通过将MS / MS光谱评价到从基因组和转录组信息获得的蛋白质数据库来发现新肽的技术。蛋白质组织常涉及使用蛋白质组学结果对更好的基因注释,通常从质谱中获得的研究。基因组学是对整个生物的遗传密码的研究,而转录组织是RNA测序和转录物的研究。
关于我们的蛋白质组织服务
作为具有多年素素体论知识的突出公司,创意蛋白质组学提供国家和最可行的质谱技术,为您的肠道标准组科的研究增添重要意义。通过获得蛋白质组学信息,我们的蛋白质组织服务可以大大改善基因注释。我们可以提供的两个战略路径中的第一个是与质谱相关的二维电泳;第二种是与质谱集成的色谱法,也称为霰弹枪技术。两种策略涉及通过测定蛋白质的电荷比(M / Z)的质量来进行质谱和结构分析。
图1. LC-MS / MS和MS / MS的蛋白素学MOMICS分析。(Nesvizhskii,2014)
我们的优势
- 特殊敏感性
- 巨大的序列,结构和功能信息
- 对大型生物和小有机分子的可用性
- 肽和蛋白质序列评估
- 获得巨额数量的信息
工作流程和生物信息学分析
分析内容 | 细节 |
功能注释 | 评估数据集中的个体蛋白质并分配每个特定功能 |
蛋白质数据库搜索和注释 | 在公共和商业数据集中进行引用数据评估,以确保比较和注释的完整性和准确性。还有可访问的是de novo搜索和同源性搜索。 |
定量分类学分析 | 对于比较点谱系研究,蛋白质量化至关重要。定量主要显示来自分类学的微生物群的水平。 |
聚类 | 在统计距离配置的地面,将观察到的数据库分成几个子类或群集。 |
代谢途径连接分析 | 对所选代谢过程的特定蛋白质的评估将有助于研究人员更好地理解主要细胞信号和代谢网络,以及揭示微生物群生物框架。 |
参考资料
1. nesvizhskii ai。蛋白质组:概念,应用和计算策略。自然方法。2014,11(11)。
2. Aires J,Butel MJ。蛋白质组学,人体肠道微生物群和益生菌。蛋白质组学专家综述。2011,8(2)。
3.校正VJ,Kalnejais LH,Mueller Rs等等。天然嗜酸性微生物群落密切相关细菌的生态分歧的蛋白质组织基础。国家科学院的诉讼程序。2010,107(6)。
4. Delmotte n,knief c,chaffrons等等。社区蛋白质蛋白酶体揭示了文学细菌的生理学的见解。国家科学院的诉讼程序。2009,106(38)
*仅供研究使用。不适用于诊断程序。