肠道细菌16S测序服务
肠道菌群是一个复杂多样的微生物群落，在体内稳定和疾病期间对宿主有显著影响，它生活在人类胃肠道(GI)通道中。各种因素导致了人类肠道微生物群在童年时期的形成。饮食被认为是肠道菌群终生成型的主要驱动因素之一。肠道细菌在维持免疫和代谢稳态以及抵御病原体方面发挥着重要作用。许多炎症性疾病和感染的发病机制与肠道细菌结构(失调)的改变有关。本研究的分析基于对个体间变异、胃肠道内细菌种群的异质性、功能冗余以及在生态失调状态下区分因果关系的需要的更深入的理解。
细菌16S扩增子测序
16s rRNA基因是细菌和古菌中保存最完好的基因标记，在细菌和古菌的属、种分类和分类学上具有重要意义。对于高变异区域，其替代率大约是高度保守区域的7000倍，这包括了基于这些遗传差异的丰富的分类学数据。因此，利用PCR获得的16S基因扩增子可以根据生物信息学配置确定分类学分类。
16S rRNA基因测序是一种扩增子测序，读取所有细菌和古菌16S rRNA基因的一个区域，这意味着只有这类微生物才能被这种测序方法识别。16S rRNA测序输出提供了测序'reads' (DNA序列串)，可以使用大量的基本生物信息学阶段进行分析，这些阶段可以被称为“管道”。为了“清理”可以连接到微生物基因组数据集的信息，以正确分类和剖析样本中存在的细菌(和古菌)，这些生物信息学管道消除了测序错误或可疑读数。
关于我们的服务
创造性的蛋白质组学作为NGS产品的最大供应商之一，我们提供了多组学解决方案。16S/18S/ITS扩增子测序具有性价比高、速度快、实用性强的特点。为了帮助您定义和评估微生物群落，我们提供全面的肠道细菌16S扩增子测序服务。
我们的优势:
- 16S核糖体RNA NGS为鉴定传统方法无法发现的菌株提供了一种经济有效的技术
-免培养过程，有助于在标本中分析整个微生物种群
- NGS提供在测序运行中集成多个样本的能力
-灵敏度和准确度高
-价格实惠，专业团队
工作流程和生物信息学分析
| 生物信息学分析 | 细节 |
| 标记装配 | 对于原始序列的重建，对较长DNA序列的片段进行排列和整合 |
| 辣子鸡集群 | 细菌类群近似 |
| 物种的注释 | 沿着基因组序列对功能部件进行分类 |
| 物种分析柱状图 | 对标本进行物种和丰度的评估。 |
| 种系发生树 | 展示不同生物物种或其他实体之间基于共性和遗传特征的进化相互作用 |
| α多样性 | 在地点或生态系统的局部尺度上的平均物种多样性 |
| β多样性 | 区域和本地生物变异的百分比 |
创造性的蛋白质组学提供高深度、高精度的肠道细菌图谱服务，以满足研究人群遗传学和胃肠道微生物图谱的需要，以研究这些微生物与人体的生物多样性和相互作用。我们基于16S扩增子测序的细菌分析方案使用寡核苷酸探针设计目标和捕获感兴趣的区域——通常是保守基因的高可变区域或基因间区域，其次是下一代测序，通过与微生物数据库和生物信息分析进行比较，以达到高效的遗传变异识别和表征的目标。如果您对我们的amplicon测序服务感兴趣，并想了解更多，请随时访问联系我们！
引用:
1.张永杰，李胜，甘瑞娟,等．肠道细菌对人类健康和疾病的影响．国际分子科学杂志．2015年,16(4)。
2.陈志强，陈志强，陈志强，等。肠道共生细菌的免疫调节机制。免疫学的趋势。2005年,26(6)。
*只供研究用途。不用于诊断程序。