宏蛋白质组学分析服务
蛋白质是基因功能的直接体现。宏蛋白质组学是指环境微生物在某一时刻表达的全部蛋白。宏蛋白质组学的研究类型非常多样，如活性污泥微生物、海洋微生物、土壤微生物、发酵食品微生物、肠道微生物、粪便、粘膜腔等。在微生物宏基因组数据的基础上，进一步研究其相应的蛋白质组成和功能，可以深入探索功能分子在微生物种群中的丰度分布和功能定位。
大量研究表明宏蛋白质组学在研究肠道菌群在健康和疾病中的功能作用方面具有应用价值。宏蛋白质组学不仅可以研究疾病状态下肠道菌群的组成和代谢变化，还可以考虑与疾病相关的生化途径的动态变化。
Creative Proteomics拥有高分辨率串联液相色谱质谱平台(LC-MS/MS)，基于无标签蛋白质组学Shotgun技术来解释肠道微生物。此外，我们还可以实现一站式、个性化的数据分析，帮助实现数据可视化。
哪些样品更适合宏蛋白质组学?
1.成分复杂，干扰多
2.微生物种类繁多
3.受外界环境因素(季节、温度、湿度等)影响较大
4.复杂的空间位置
5.其他生物的存在，如动物和植物
你能得到什么信息?
- 获取样本中不同物种的所有蛋白质信息
- 分析样品中微生物群落的组成和功能，揭示微生物与环境的关系
- 揭示样品微生物群中变化的分类、功能和代谢途径
宏蛋白质组学分析技术平台
- 电喷雾串联质谱(ESI-MS/MS)
- 纳米液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)
从肠道提取的粪便样本的元蛋白质组学分析流程(Petriz et al.， 2017)
宏蛋白质组学的应用
- 生物医学:肠道菌群与重大疾病关系的研究。
- 微生物学领域:致病机理、耐药机理、病原与宿主相互作用研究等。
- 临床诊断:生物标志物发现、疾病机制、疾病分类等。
生物信息学分析
- 去函数注释
- KEGG通路注释
- COG功能分类注释
- 统计分析
- 功能分类注释和富集分析
- 表达模式的聚类分析
- 蛋白质相互作用网络分析
- 物种丰度分析
参考
1.Petriz, Bernardo A.和Octávio L. Franco。“宏蛋白质组学作为健康和疾病中的肠道微生物群的补充方法。”化学前沿5(2017): 4。
*只供研究用途。不用于诊断程序。
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