相互作用蛋白质组学和蛋白质网络分析
宿主，通过蛋白质，代谢物，小分子和核酸，与微生物群连通。为了修饰宿主细胞功能和免疫应答，微生物群包括各种效应。它们具有专门的主机交互，网络表示允许有效地可视化这些关系。大多数细菌和真核病原体蛋白质不能连接到宿主蛋白，但它们的一些蛋白质可以连接或到宿主细胞以宿主表面受体并与宿主的细胞质蛋白接合。许多细菌物种具有注射器样装置，通过该装置，它们立即将细菌效应注入宿主细胞的细胞质中。它们是基于通过宿主相互作用的关键过程改变宿主生理信号传导，避免宿主免疫框架，改变细胞骨骼组织，改变膜和囊泡贩运，促进病原体通道进入宿主，转化细胞周期，调节细胞凋亡。所有人都在宿主内旨在保证其存活率和复制。具有微生物群靶向和打开或关闭的主机信令机制可以修改细胞的结果。对于共生和病原体来说，揭示了HMIS可以详细说明他们如何重新配置主机信令的路径，并有助于建立新的治疗策略。
图1所示。肠道宏蛋白质组学揭示宿主与微生物的相互作用。(加文,2018)
我们的互动蛋白质组学和蛋白质网络分析服务
作为蛋白质组学多年专业知识的卓越公司，创造性的蛋白质组学提供综合交互蛋白质组学和蛋白质网络分析服务。对于有针对性和未确定的元标准评估，我们展示了最先进的2D-LC方法。
在元蛋白质组学研究中，二维液相色谱(2D-LC)是最常用的多维液相色谱方法，适用于分离分子尺寸变化较大的蛋白质、丰度降低的蛋白质和疏水性蛋白质。2D-LC可用于解决复杂的天然混合物、生物标志物、(meta)蛋白质组学和不同生物学情况下的代谢组学问题。2D-LC与质谱联用可提供海量的定性和定量信息，极大地提高了检测深度，在蛋白质组学和宏蛋白质组学等领域复杂、难以分离组分的分离中起着至关重要的作用。然而，这些增强驱油的代价通常是很长的分析时间(比如几个小时到几天)，因此2D-LC确实是一种小众策略，限制在所有液相分离的一小部分。
工作流程和生物信息学分析
我们的优势
- 分离能力大大提高。
- 启用自动性能，以避免在分离框架之间的线条分数繁琐且耗时的传输。
- 增强的分类能力。当具有检测容量的传感器与多维液相色谱（MDLC）系统耦合时，可以进一步增强这种益处。
生物信息学分析
| 分析内容 | 细节 |
| 主成分分析 | 为了评价蛋白质轨迹，主要成分分析被使用。 |
| 集群分析 | 用于探索多维数据信息的重要数据挖掘方法之一是群集评估。它在诸如蛋白质的一组兴趣数据中使用，以识别类似物体的模式或组。 |
| 鉴定生物标记物 | 与免费数据库（HMDB，脂质地图，KEGG等）相比，这有助于阐明代谢物/生物标志物和特定过程，可获得生物标志物鉴定。 |
| 代谢通路连接分析 | 特定蛋白质的分配到所选代谢过程将使您更容易识别关键的细胞信号和代谢网络，并将揭示微生物群的生物过程。 |
在肠道微生物群研究领域，创造性的蛋白质组学致力于提供最高水平的服务。根据您的样品和研究目的，我们将提供最优的策略。想了解更多关于我们的互动蛋白质组学和蛋白质网络分析服务，请联系我们。
参考文献
1.基于质谱的二维毛细管色谱联用研究。毛细管色谱与质谱联用2020(第369-412页)。爱思唯尔。
2. Gavin PG，Mullaney Ja，Loo D.,等．肠道宏蛋白质组学显示1型糖尿病风险受试者的宿主-微生物群相互作用。糖尿病护理．2018年,41(10)。
3.王志强，王志强，王志强。微生物与宿主相互作用网络的结构。PLO计算生物学．2017年10月12日; 13（10）：E1005579。
4.生物信息学工具代谢组学数据处理和分析使用非目标液相色谱-质谱联用。克鲁日-纳波卡农业科学与兽医大学通报。动物科学与生物技术．2015,72（2）。
*仅供研究使用。不适用于诊断程序。