液相色谱 - 串联质谱（LC-MS / MS）服务
肠道微生物群是一种充满活力的社区，是人类健康和健身的关键。肠道微生物瘤的脱蛋白可能导致一系列问题。通过进行元标分析，研究人员可以从新角度看肠道微生物群。自2004年提升以来，Metaprootomics是一个专注于从复杂社区鉴定的所有基因和蛋白质的主题，在过去十年中经历了巨大的进展。回到早期阶段，主要通过2D-凝胶电泳的方法进行元标研究，然后手动接种单个蛋白的质谱分析，其是耗时，费力且相对较低的吞吐量。现在，在Metaprootomic研究中投入了更多先进的技术，并提供了从肠道微生物肿瘤样品中解析基因型 - 表型键的能力。液相色谱 - 串联质谱（LC-MS / MS）可以检测单个样品内的微生物群中数万的蛋白质，并且还测定检测到肽的氨基酸序列和相对丰度信息，这允许表现表现蛋白质在社区内的功能和对微生物谱系进行的具体比赛，具有潜在的亚种分辨率。
图1.标准瘤在肠道微生物研究中的应用（Xiao 2017）
创意蛋白质组学作为在蛋白质组学中具有多年经验的卓越公司，提供领先的肠道元标题LC-MS / MS服务，工作流程通常属于以下步骤：
蛋白质提取
样品制备（蛋白质提取）是蛋白质组学研究的关键步骤，样品的质量在大量上称重。我们根据原料的状态和研究目的提供精致的蛋白质提取技术，以保证具有高保真性和可靠性的结果。
蛋白质纯化
蛋白质的纯化是确保LC-MS / MS检测的样品质量的另一个关键步骤。我们提供各种解决方案，如FASP消化和SDS-PAGE，全部朝着孤独的目标 - 测试结果的准确性和保真度。
胰蛋白酶消化
胰蛋白酶消化将蛋白质分解为LC-MS / MS检测的肽，我们提供解决的解决方案，包括抑制消化和凝胶消化。
LC-MS / MS
我们的LC-MS / MS仪器可以每小时产生数万个高分辨率光谱，这使得肠道元素的深入分析能够揭示与基因组技术相结合的蛋白质丰度，功能甚至基因型 - 表型联系的各种信息。
图2.基于LC-MS / MS的Metaprootomics工作流程概述（Ryan 2013）
数据分析
结合优化的算法和强大的计算平台，我们可以处理LC-MS / MS产生的大量数据，并从峰值列表到蛋白质数据库搜索以及标准瘤分析和可视化的全面包装。分析项目包括但不限于：
- 光谱过滤
- 数据库搜索算法
- 德诺维测序
- 获取元信息
- 组冗余蛋白质识别
- 统计测试
- 相关分析
- 聚类
- 主要成分分析
- 分类档案
- 功能概况
- 途径分析
我们致力于在肠道微生物群研究中提供最高级别的服务。要了解有关LC-MS / MS服务的更多信息，请随时为联系我们。
参考资料
萧米;等等。肠道微生物研究的数组策略和应用。应用微生物学和生物技术。2017,101。
2.瑞安;等。微生物属性分析分析的样品处理和质谱。酶学方法。2013,531。
*仅供研究使用。不适用于诊断程序。