生物标志物是个人健康状况的客观指标,可以精确且始终如一地测量。为了更好地了解疾病发病机制和相关变化,促进疾病治疗的发展,需要稳健和验证的生物标志物。常规方法从生物标志物基因组学提供比我们的下一代测序(NGS),基因分型和知识从生物标志物基因组学提供远的透视。
肠道微生物组中的生物标志物基因组学
最近的突破增加了生物标志物的发现和分析,在NGS,微阵列和生物信息学。科学家可以利用生物标记基因组学来创造足够的信息来扩展人类基因组,同时回答各种各样的问题。生物标志物基因组学使用不同的技术,如全球范围或特定区域的DNA、RNA和基于甲基的分析。这使得科学家能够以高通量和精确的方式识别已知和新的生物标志物,并帮助临床从药物探索到决策。在定制药物中,生物标志物基因组学还用于根据患者的遗传信息预测医疗诊断和治疗。
图1所示。WGS生物信息学管线的示意图。(赵,2015)
关于我们基于WGS的生物标记识别服务
创造性的蛋白质组学是一家专注于多组学研究的知名公司。我们拥有丰富的知识,与您在研究中可能遇到的各种问题相关,结合前沿的方法,并由经验丰富的研究人员提供。由于多组学技术和资源的卓越进展,微生物群生物标志物的研究正在迅速扩大,我们可以提供强大的工具和最合理的解决方案,支持您的肠道微生物群和生物标志物研究。强调肠道微生物群生物标记物为阐明生理过程、代谢途径、发病机制等方面的研究提供重要信息。
全基因组测序是单次测定生物体基因组的全DNA序列,涉及储存在线粒体和叶绿体中的染色体DNA和DNA。随着精度提高,全基因组重构可以检测单核苷酸多态性(SNP),插入和缺失(诱导),结构变异(SVS),拷贝数变异(CNV)等序列物种中的其他遗传改变等DNA生物标志物。它还提供了一个终身终身的机会,以表征人口的多态变化,揭示物种原产地,发展,增长和演化的潜在过程。
我们可以从所有遗传水平,转录水平,表达水平和代谢水平提供彻底的生物标志物评估,并协助您确定特定的生物标志物并探索尚未定义的单一或多个生物标志物,因为我们的专业知识包括多个多的频谱- 诸如偏心组织,metaTransfriptomics,metabroomics和代谢组学。
我们的优势
- 单个基对分辨率
- 分类德诺维测序和全基因组突变
- 种群进化与系统发育分析
- 药物探索和开发,以及定制药物,都是研究人员正在努力的领域。
工作流程和生物信息学分析
分析内容 | 细节 |
De Novo组装 | 从大量(短期或长)DNA片段创建基因组,没有先前了解其适当序列或订单。 |
参考基因组的映射 | 在基因组中发现读取的位置,然后在这些读取时,呼叫变体或构建对齐读取序列的共识序列。 |
SNP / Indel / SV / CNV呼叫 | 单核苷酸多态性、插入/删除、结构变异和拷贝数变异都可以用这种方法发现。 |
答录 | 对基因组中的基因位置和所有编码区域进行分类,并确定这些基因的功能。 |
途径分析 | 采用基因表达率,利用特定生物的当前信息来定义潜在的生物过程和机制。 |
在肠道微生物群研究中,创造性的蛋白质组学致力于提供最高水平的解决方案。我们将根据您的标本和研究目标推荐最佳计划。我们将非常乐意支持您的学业,以便需要肠道微生物群和宣传人类健康和福祉的工作。请随时接触我们了解肠道微生物群和生物标志物的更多选择。
参考文献
1.托雷斯J,Petralia F,Sato T,等.血清生物标志物判断患者在诊断前5年内发展炎症肠疾病。胃肠病学.2020,159(1)。
2.赵伟,陈俊杰,Foley S,等.从下一代测序数据中识别生物标记物用于病原菌鉴定和监测。生物标志物在医学.2015年,9(11)。
3.Iskandar HN, Ciorba MA。炎症性肠病的生物标记物:当前实践和最新进展。翻译研究。2012年,159(4)。
*仅供研究使用。不适用于诊断程序。