构成肠道病毒的病毒几乎等于细菌细胞的数量。每个克的人肠含有大约10个8.-109.病毒样颗粒(VLP),其中大多数是属于家庭Podoviridae的跨装配噬菌体。病毒与微生物组内的其他生物相互作用,在那里它们最终可以改变宿主表型,因为它们直接影响疾病易感性和抗性的能力,导致生物体的有益或有害影响。目前,只有1%的病毒组被测序,留下了大多数病毒体尚待识别。
病毒测序
许多方法可以应用于病毒鉴定。较老的参考文献依赖于电子显微镜和毒力特异性方法。修饰的提取和初始随机扩增使得所有病毒鉴定研究的微阵列敏感。目前,测序是一种准确,有效,也是最广泛使用的病毒识别方法。杂交和基于PCR的方法对于富集是有效的,这大部分降低了核酸污染和测序深度。
关于我们的服务
in.创造性的蛋白质组学,我们基于ngs的肠道病毒识别旨在以一种快速、负担得起的高通量和简化的方式有效地识别物种。我们优先提供高精度和高灵敏度的数据。我们的服务具有实验过程中的无菌操作、用户友好、准确及时、高通量、检测新病毒株等优点,满足鉴定和研究的要求。
通过单一遗传目标或全基因组策略,通过基于NGS的微生物鉴定,通过单一遗传靶或全基因组策略进行微生物群体,微生物群落,进化研究和相关性分析微生物分配。
我们的优势:
-基于杂交/扩增的富集方法允许经济有效的鉴定
-下一代测序提供了一个免培养的过程,有助于在一个样本中分析整个微生物种群
NGS提供了集成多个样本的能力
-灵敏度和准确度高
-价格实惠,专业团队
工作流程和生物信息学分析
生物信息学分析 | 细节 | |
常规识别分析 | 样品的形态学,物理和化学性质 | |
成分分析 | Rank-abundance曲线 | 检测样品中物种的丰富和分布 |
出来分类 | 种属鉴定 | |
多样性分析 | alpha多样性 | 生态系统中物种的多样性 |
Beta-analysis | 样品之间的比较研究 | |
比较分析 | 主成分分析 | 微生物种群之间的相关性 |
NMDS分析 | 微生物样品随时间变化的相似性和动态性 | |
乔治。 | 研究组之间的聚类 | |
进化分析 | 系统发育树建设 |
创造性的蛋白质组学以高深的深度为高精度提供肠道病毒分析服务,以满足胃肠道中群体遗传和微生物谱的需求,以便研究这些病毒和人体之间的生物多样性和相互作用。我们浓缩的病毒分析协议使用杂交和扩增来研究您兴趣的病毒。如果你有兴趣在我们的扩增子测序服务,想了解更多信息,随意联系我们!!
参考:
1. Bexfield N,Kellam P. Metagenomics和新型病毒的分子鉴定。兽医杂志》.2011、190(2)。
*仅供研究使用。不适用于诊断程序。