代谢组是指一个有机体或细胞在一定生理周期内的所有低分子代谢产物(包括代谢中间体、激素、信号分子和次级代谢产物)的集合。它是细胞变化与表型相互联系的核心,直接反映细胞的生理状态。
与植物和动物代谢组学相比,生长培养基中微生物的浓度较低。它具有代谢物浓度低、检测困难、细胞内外代谢物分离困难的特点。微生物代谢组学主要分析细胞内代谢产物。由于细胞内存在活跃的酶系统和代谢产物快速转化,取样和样品制备的方法将显著影响分析结果的准确性和重现性。
创造性的蛋白质组学建立了准确、灵敏、高通量的微生物代谢组学分析平台,可以对一个生物或生物系统中的所有代谢物进行定性和定量分析,为进一步了解相关代谢途径及其变化提供关键信息。
我们能提供什么
- 有针对性的代谢组学分析:目标小分子的鉴定和定量分析,包括微生物一级代谢物和二级代谢物。
- 诸多代谢组学分析:不偏不倚检测所有小分子代谢物在受到刺激或干扰前后的动态变化,通过生物计量分析筛选差异代谢物,并对差异代谢物进行通路分析。
微生物代谢组学分析流程
样品制备
代谢产物的快速采样、猝灭和提取:保持细胞的完整性,防止细胞内代谢产物的泄漏,正确反映微生物细胞的生理状态。
代谢物的检测、分析和鉴定
我们提供两种技术平台:质谱(MS)和核磁共振(NMR)。
气相色谱-质谱联用
液相色谱-质谱联用技术
毛细管电泳-质谱(CE-MS)
数据处理与分析
数据处理:一般包括基线校正、特征检测、噪声滤波、峰值对准、标准化和归一化、等。
数据分析:主成分分析和偏最小二乘判别分析(PLS-DA)等多元统计分析和生物信息学分析。
微生物代谢组学分析的应用
乳酸菌研究
微生物代谢组分析可用于菌株筛选鉴定、代谢途径分析、发酵工程等分析。
肠道微生物群的研究
肠道代谢物可影响肠道微生物组成、基因表达和代谢物。在许多疾病中,肠道微生物种群的结构变化和代谢变化,以及宿主血液或组织的代谢变化都可能发生。通过微生物组和代谢组的联合研究,有助于发现在生理和疾病过程中起关键作用的微生物和代谢产物,揭示生理过程和疾病发生发展的机制。
病原体的研究
微生物代谢组学分析可用于病原菌突变分析和次生代谢产物的检测与筛选
食物和营养
食品微生物降解产生的病原体、毒素和副产物都与食品安全问题有关。微生物代谢组学分析可用于相关代谢物的监测,确保食品安全。营养可以用来评估营养缺乏和过量对身体新陈代谢的平衡。
样品需求
- 血液≥100µL
- 尿液≥100μL
- 组织≥50毫克
- 新鲜大便≥50毫克
- 冻干粪便≥5毫克
- 细胞≥1 * 107
*只供研究用途。不用于诊断程序。