粪便微生物组分析服务

gutfloraomics

粪便微生物组分析服务

肠粘膜不断受到大量共存微生物及其产品的影响。这些相互作用引起的免疫应答保护宿主免受致病和非团体微生物的影响。稳态的突然变化可能影响肠道中的疾病易感性和进展,这可能影响有机体的其他部位。因此,基于粪便微生物谱的微生物组和分析潜在影响的微生物组和分析潜在影响可能是诊断和治疗应用的发展的基础。

宏基因组粪便微生物组剖析

宏基因组鸟枪法测序有助于在宿主相关微生物组,宿主 - 微生物相互作用,基因预测和注释,以及疾病机制的遗传和功能多样性的发现。通过宏基因组鸟枪测序,复杂样品中所有微生物的基因可以阐明。作为基于NGS-方法,它能够检测到粪便样品有可能使用其他方法成本太高被错过或在低丰度的微生物。

关于我们的服务

in.创意蛋白质组学,我们为微生物分析提供霰弹枪偏心序列测序服务和16S种子组测序。通过单一遗传目标或全基因组策略,通过基于NGS的微生物鉴定,通过单一遗传靶或全基因组策略进行微生物群体,微生物群落,进化研究和相关性分析微生物分配。

我们的宏基因组测序平台利用切削刃测序系统如Illumina的HiSeq 2500和4000 HiSeq(PE 150)。它们产生每个样品的原始数据中的至少5千兆与用质量分数Q30的碱基的80%以上。我们的宏基因组鸟枪法测序工具是获得粪便样品中微生物有关的遗传信息的强大平台。此外,我们还提供了基于纳米孔和PacBio长读宏基因组学服务。我们的平台可以照顾到重点院校的各个领域。

我们的优势

  • 微生物群落的低丰度物种的检测
  • 多年的生命科学经验
  • 快速且价格合理的服务
  • 尖端的测序平台提供,兼具下一代和长读测序平台
  • 灵活的测序策略和数据分析。

生物信息学分析

我们的一站式服务是可定制的,以提供质量分析并满足客户偏好。我们服务的优势包括检测生命科学的多年的商业经验,快速合理的服务,快速和经济的服务,切割边缘排序平台,具有下一代和长读读取平台,灵活的测序策略和数据分析。生物信息学分为五个部分:数据QC,基因组组装,功能元素预测,基因函数注释和对比基因组分析。

分析内容 细节
数据QC 适配器序列和低质量序列去除
分类分配 序列对齐
微生物多样性分析 PCA,α和β多样性分析,汇总分析,
功能注释 Kegg,Eggng,Go等
c 基因编码的某些特性和相关性分析预测
卡片 抗性基因预测与相关分析
CAG / MLG分析 确定疾病和微生物菌株之间的关联
CNV. 微生物组CNV和疾病之间的相关分析
病原体预测 Virfinder,Marvel,Virsorter

样本要求

在向我们发送样品之前,确保它们符合以下要求:DNA量≥1.6μg,浓度≥30ng/μl,体积≥30μl,1.8 260/280<2.0。

创意蛋白质组学提供粪便微生物谱在高深度的服务,希望能引起更多有价值的见解,为了研究这些微生物与人体之间内生物多样性和互动。我们的平台包括Illumina公司Pacbio SMRT和牛津纳米孔,以满足您的需求,不管是什么,以及如何长时间你有兴趣的目标是。如果你有兴趣在我们的扩增子测序服务,想了解更多信息,随意联系我们!!

参考:

1. Park SJ,Kim J,Lee JS等等。用高通量测序表征不同猪群中的粪便微生物组。anaerobe.。2014年1,28。

*仅供研究使用。不适用于诊断程序。

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