微生物广泛分布于地球上的各个生态系统中,在碳、氮、硫的物质循环中发挥着重要作用。随着生物信息学的发展和多组学的综合应用,对微生物功能、代谢和群落结构的系统研究越来越深入。
微生物16S/18S/ITS测序服务
16S RDNA序列包含9个可变区和10个保守区域。可变区域与细菌不同于细菌,并且变异程度与细菌的系统发生密切相关。通过检测16S RDNA的序列变化和丰度,我们可以了解环境样本中的社区分集信息。基于16S RDNA的分析在微生物和微生物研究的分类和鉴定中起重要作用。
18S RDNA或其(内转录的间隔物)广泛用于真核生物和真菌的分类和鉴定。图18SRDNA更适合于系统发育研究中的物种水平以上的元素的分类。其序列位于18秒,5.8s和28s的真菌rRNA基因之间,其是其1及其2个。它属于一个中等保守的区域,可用于研究物种和分类水平以下。
创意蛋白质组学可以为您提供16s / 18s /它和其他微生物物种特征序列放大和高通量测序以及专业的生物信息分析。
- 生物信息学分析
OTU聚类和分析
物种分类
单样本分集分析(alpha多样性)
样本间多样性的比较分析(beta多样性)
物种差异分析
功能分析:Kegg功能预测,COG功能预测
关联分析和模型预测
微生物组织测序
Metagenomic分析将所有微生物的基因组作为研究对象中的所有微生物,并通过环境样品中全基因组DNA的高通量测序获得单个样品的饱和数据量。基于De Novo组件,分析微生物群落结构的多样性,微生物群的遗传成分和功能,以及与特定环境相关的代谢途径。
- 生物信息学分析
基因预测和基因组构建
遗传分析:维恩图和差异分析
基因集功能注释:Eggnog,Kegg,卡,Cog,Cazy,Swiss-Prot,NR,等。
物种的分析
功能分析
多样性分析
网络交互
相似性分析
关联分析和模型预测
微生物代谢组学分析
有针对性的代谢组学分析:目标小分子的鉴定和定量分析,包括微生物一级代谢物和二级代谢物。
未确定的代谢组科分析:不偏不倚检测所有小分子代谢物在受到刺激或干扰前后的动态变化,通过生物计量分析筛选差异代谢物,并对差异代谢物进行通路分析。
- 生物信息学分析
代谢物分类注释和功能注释分析
差分代谢物的筛选(PCA分析,PLS-DA,等。)
微分代谢物的分析
微生物蛋白质组学分析
Creative Proteomics建立了一个准确、灵敏、高通量的微生物蛋白质组分析平台,用于研究蛋白质的特性,包括蛋白质表达水平、翻译后修饰和蛋白质相互作用。
- 生物信息学分析
功能注释(GO、KEGG、COG)
统计分析(火山图、斑图等)
丰富分析(Go,Kegg)
聚类分析
蛋白质 - 蛋白质相互作用分析
创造性的蛋白质组学可以为您提供微生物组分析服务和高质量的结果报告。如果您对以上服务有任何疑问或咨询其他微生物组分析服务,请联系我们.
*只供研究用途。不用于诊断程序。