微生物组16S测序服务
Creative Proteomics提供微生物16S/18S/ITS扩增子测序服务、宏基因组测序服务和专业的生物信息学分析，能够快速准确地识别样品中微生物的物种组成和多样性，并获得群落进化关系、物种结构、群落功能等多种生物信息。
微生物16S扩增子测序
16S扩增子测序使用合适的通用引物来扩增微生物16S rDNA高变区或功能基因。它是一种高通量测序技术，用于检测PCR产物的序列变化和丰富信息，分析环境中微生物群落的多样性和分布，揭示环境样品中微生物的类型、相对丰度和进化关系。
18S RDNA或其（内转录的间隔物）广泛用于真核生物和真菌的分类和鉴定。图18SRDNA更适合于系统发育研究中的物种水平以上的元素的分类。其序列位于18秒，5.8s和28s的真菌rRNA基因之间，其是其1及其2个。它属于一个中等保守的区域，可用于研究物种和分类水平以下。
- 生物信息学分析
OTU聚类和分析
物种分类
单样本分集分析（alpha多样性）
样本间多样性的比较分析(beta多样性)
物种差异分析
功能分析：Kegg功能预测，COG功能预测
关联分析和模型预测
对于16S测序，任何一个或几个高度可变区域，尽管它们的高度可变性，可能对某些物种非常相似。能够区分它们的特定序列片段可能不在扩增区域。因此，可以选择全长可变区序列进行测定，该序列覆盖范围广，能够准确识别物种水平。
微生物16S宏基因组测序
Metagenomics将整个微生物群体作为研究对象。无需分离和培养，并且可以直接提取来自环境样品的DNA以进行测序。16S偏心神经可用于研究群落结构，物种分类，系统演化，基因功能和环境微生物的代谢网络。
- 生物信息学分析
基因预测和基因集结构
遗传分析:维恩图和差异分析
基因集功能注释：Eggnog，Kegg，卡，Cog，Cazy，Swiss-Prot，NR，等。
物种的分析
功能分析
多样性分析
网络交互
相似性分析
关联分析和模型预测
如何选择?
| 扩增子测序 | Metagenomic测序 | |
| 测序原理 | 将提取的微生物基因组DNA在某个或几个高变区序列(V4区或V3-V4区)上进行PCR扩增，构建文库并进行测序。 | 微生物基因组DNA随机分成300 ~ 500bp的小片段。在片段的两端添加排序适配器并执行排序。 |
| 种鉴定深度 | 许多测序得到的序列并没有在物种层面上进行注释。 | 可以在物种水平甚至菌株水平上识别微生物。 |
| 研究目的 | 主要研究社区的物种复合物，物种与社区多样性之间的进化关系。 | 基于16S测序分析，对基因和功能深入研究（GO，途径，等。)也可以进行。 |
创意蛋白质组学可为您提供微生物16s扩增子测序、宏基因组测序和高质量的结果报告。如果您对以上服务有任何疑问或咨询其他微生物组分析服务，请联系我们．
*只供研究用途。不用于诊断程序。