代谢组学创造性蛋白质组学

组织代谢组学服务

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概述

在大多数代谢组学研究中使用血浆、血清或尿液,因为这些体液容易获得,并且可以以微创或非侵入的方式收集。然而,疾病中的代谢变化通常是基于组织的。为了表征疾病表型下的代谢变化,直接分析动物模型组织样本或人体活检样本的代谢组学变化是有益的。组织采集是侵入性的,但可以对病变和非病变组织区域的代谢物谱进行比较分析,从而筛选差异代谢物,促进疾病机制研究。

使用组织样本进行代谢组学研究面临许多挑战,如组织不均匀性、组织收集、代谢爆发、组织均质化和代谢物提取。相同的样品预处理、使用的溶剂和不同的提取方案可能导致有偏差的结果。靶向或非靶向代谢组学策略的选择也会影响所分析的代谢谱和所获得数据的生物学解释。没有一种提取方法能满足提取所有代谢物的要求。因此,代谢组学分析中最合适的折中提取方法是根据研究需求、吞吐量和处理效率等多种因素选择的。

有时我们可能样本量有限,例如人类活组织检查中可用的组织数量有限,而常用的小鼠模型中可用的组织数量很少,因此有必要开发一种高效且节省组织的代谢物提取工艺,以满足伦理和实际需求。

Creative Proteomics提供基于LC-MS/MS平台的组织样品的定制代谢组学分析。根据样品和研究需要,我们优化了多种样品预处理和提取方案,可以同时从单个少量组织样品中提取和分析代谢物相关产品。我们不仅可以提供目标代谢物或一类代谢物的绝对定量分析,还可以提供所有代谢物的非靶向代谢组学分析,以筛选差异代谢物。

我们可以提供:

非靶向代谢组学分析:

  • 代谢谱分析
  • 鉴别代谢物的筛选
  • 差异代谢物的代谢途径分析
  • 发现新的生物标志物

组织代谢组学服务

目标代谢组学分析:

  • 模式:SRM / MRM
  • 分析内容:建立标准曲线。原始数据预处理。代谢物的绝对定量。

组织代谢组学服务

可交付成果

  • 实验的程序
  • 液相色谱和质谱参数
  • MS原始数据文件和MS数据质量检查
  • 生物信息学分析报告

周转时间:2 - 6周

生物信息学分析

标准分析 1.数据质量控制(QC相关分析,总样本PCA分析)
2.代谢产物的定性和定量结果
3.差异代谢物筛选(PCA, PLS-DA降维处理,火山图)
4.差异代谢物分析:维恩图、聚类热图、代谢物相关分析、Z-score分析、通路分析、ROC分析
个性化分析 加权基因共表达网络分析(WGCNA)
单向方差分析

Creative Proteomics为组织样本提供代谢组学服务,并将为您提供准确详细的数据和分析报告。如果您想检测其他代谢物但还没有发现,您可以通过调查形式,我们的技术人员会与您进行沟通。

仅供研究使用。不适用于诊断程序。
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