与生物化学实验中常用的SDS-PAGE法(误差±10%)测定特定蛋白(MW 15, 000~20, 000Da)相对分子量相比，基质辅助激光解吸/电离(MALDI)飞行时间(TOF)质谱法提供了更准确、准确的测定方法。快速和可重复测定蛋白质/多肽分子量。作为一种软电离技术，MALDI允许分析生物分子(生物聚合物，如DNA、蛋白质、多肽和糖)，当用传统方法电离时，这些分子往往是脆弱的和碎片化的，而与另一种软电离方法电喷雾电离相比，产生的多个带电离子要少得多。TOF质谱法通过测量离子在电场加速下的质量电荷比来确定离子的质量电荷比。
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