生物信息折叠变化分析服务


褶皱变化(FC)是描述最终和原始值之间的数量变化程度的措施。例如,对于原始值为20的数据集和最终值80,相应的折叠变化为3,或以共同术语,增加三倍。折叠更改仅计算为最终值与初始值之间的原始值之间的变化的比率。因此,如果原始值是x和最终值是y,则折叠变化是(y-x)/ x或等效的y / x - 1.作为另一个例子,从60到30的变化将是折叠的变化 -0.5,而30至60的变化将是1的折叠变化(原件的2倍)。

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然而,这种用法可能会引起混淆和歧义。例如,尽管2倍是200%,或2x, 2倍的增长,如上所述,被一些人理解为300%的增长,如“90是30的2倍”。然而,一些词典,包括牛津英语词典和梅里亚姆-韦伯斯特词典,以及柯林斯的数学词典,把“-fold”定义为“次”,如“3-fold”=“4次”。可能因为这个定义,许多研究人员使用“折叠”和“折叠变化”作为“时间”的同义词,如在“2倍大”=“2倍大”。这个领域的一些专家坚持使用fold change,如“40是20的1倍。”因此,有人认为应该避免使用折叠变化,如“X比15大3倍”,因为有些人将这解释为X是45,而其他人将这理解为A是60。

Fold change法在转录组学、蛋白质组学和代谢组学中常用来分析基因表达数据,测量不同条件下的变化。折叠变化分析的明显优势是它对生物学家有意义。在这种情况下使用fold change方法的一个缺点和严重风险是它有偏倚,可能会遗漏差异大(Y-X)但比例小(X/Y)的差异表达基因,导致高强度下的高漏失率。

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