近年来,研究系统生物学中微生物代谢网络的结构与功能之间的关系成为人们关注的热点。中心碳代谢在代谢网络中起着重要的作用,由碳从营养物流向生物量的过程组成。在先进分析技术的协助下,经过几十年的艰苦努力,碳通量途径的结构和功能已经得到了很大的澄清。在经典的教科书中,中心碳代谢被定义为由糖酵解途径、柠檬酸循环、磷酸戊糖途径、六种已知的碳固定途径和甲烷代谢的一些途径组成,尽管这种代谢的定义还有待实验验证。
这一定义是由于对碳水化合物的全面研究和对中心碳代谢结构和代谢网络的广泛实验阐明而产生的。有微小的变化取决于生物体生存的生态位。在一些物种中,如糖化古菌,修饰的非磷酸化ED途径被认为取代了传统的EMP途径。
六种固碳途径如下(1) 植物和蓝藻中参与产氧光合作用的还原性戊糖磷酸循环(calvin循环)(2) 光合绿硫细菌和一些化石自养生物存在还原性柠檬酸循环(3) 在光合绿色非硫细菌中发现的3-羟基丙酸双循环(4) 羟基丙酸-羟基丁酸循环(5) 二羧酸羟基丁酸循环也在Crenarchaeota。产甲烷细菌存在乙酰辅酶a还原途径。
在一系列复杂酶的帮助下,中心碳代谢将糖转化为代谢前体,用于产生整个细胞的生物量。中心碳代谢结构遵循最优原则。研究发现,中心碳代谢是生物量必需的12种前体代谢物和糖酵解中ATP平衡所需的一种前体之间的最小步数。在中心碳代谢网络中,每一对连续的前体通过最短的酶反应连接起来。同时,输入的糖以最少的可能酶途径转化前体。
LC–MS/MS平台能够同时对生物系统中的多种代谢物进行相对和绝对定量。通过研究代谢物浓度的相对变化,这些结果被广泛应用于生物标志物的发现。所得数据已被广泛应用于生物标志物的发现。通过提供精确的分子量和保留时间,LC–MS/MS技术成为鉴定和定量小分子(代谢物)的有力分析工具。创新的蛋白质组学建立了灵敏、可靠、准确的HPLC-MS/MS方法来定量分析中枢碳代谢途径中的代谢物。
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中心碳代谢在本服务中定量的代谢物
创新的蛋白质组学具有一套完整的分离、表征、鉴定和定量系统,具有良好的鲁棒性和重复性、高灵敏度和超灵敏度,可提供可靠、快速和成本效益高的结果中枢碳代谢以代谢组学服务为目标的代谢物。