树木服务


一种树枝图(从希腊语Dendro“树”和Gramma“绘图”)是广泛用于说明由分层聚类产生的集群的布置的树图。分层聚类算法以各个集群中的每个对象开头。在每个步骤中,最相似的两个群集连接到一个新群集中。一旦融合,对象永远不会分开。树木图通常用于计算生物学,以说明基因,蛋白质,代谢物或样品的聚类。

使用欧几里德或曼哈顿距离的分层群集距离方法。欧几里德距离更广泛地使用。欧几里德距离可以被认为是直线距离。曼哈顿距离通常被称为城市 - 块距离,因为它类似于沿着虚构的人行道行走,从点A到B.

以下是最常用的方法,可以代表八种定义群集之间的相似性的方法:

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上述树形图的水平轴表示不同簇之间的距离或异化。垂直轴表示簇和物体。研究人员的主要兴趣在于相似性和聚类。通过将水平线分成两条水平线,通过将水平线分成两个曲线在该图中表示两个簇的每个连接。短垂直条示出的分体的水平位置给出了两个簇之间的距离(异化性)。

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