域注释分析服务


蛋白质结构域是特定蛋白质序列和结构的保守部分,其可以在其余的蛋白质链中独立地存在并改进。每个蛋白质结构域形成紧凑的三维结构,可以独立稳定和折叠。蛋白质通常由几个结构域组成。蛋白质结构域可以出现在几种不同的蛋白质中。在分子演化中用作结构块,这些结构块可以以不同的方式重组以产生具有不同功能的蛋白质。域的长度在约25氨基酸之间变化,高达500个氨基酸。锌指状物等最短域通过金属离子或二硫化物桥稳定。结构域通常形状的官能单元,例如钙调蛋白的钙结合EF手域。由于结构域独立稳定,因此可以通过两种蛋白质之间的基因工程“交换”以营造假想蛋白质。

例如,真核蜜碱蛋白由四个结构域组成:N末端,PAZ,中和PIWI结构域(见图。一种)。在某些情况下,特别是对于PIWI蛋白质的结构archaeoglobus fulgidus(afpiwi),中域和PIWI域分别称为域A和域B.晶体结构海床furiosusargonaute(前)用mn浸透2+(PDB标识1Z25)如图2所示。B.。该蛋白质采用双叶酸架构,具有PAZ和N末端结构域,形成一个叶片和形成另一个叶片和中间结构域。有源位点中的金属离子显示为紫色球形格式。与切片机催化部位中的金属离子结合有关的氨基酸残基以彩色棒示出。

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