KOG注释分析服务


真核生物同源组(EuKaryotic Orthologous Groups, KOGs)是同源组(Clusters of Orthologous Groups, COGs)的真核特异性版本,用于鉴定同源蛋白和类似蛋白。KOGs数据库包括7个真核生物基因组的蛋白质:3个动物(智人、果蝇果蝇和线虫线虫)、1个植物、拟南芥、2个真菌(裂殖酵母pombe和酿酒酵母)和细胞内微孢子虫Encephalitozoon cuniculi。目前的KOG数据库由4852个同源聚类组成,其中包括59,838个蛋白,占110,655个真核基因产物的54%。现在,创造性蛋白质组的科学家非常愿意为我们的客户提供最好的KOG注释分析服务

KOG注释分析服务

KOGs提供四个功能组,每个功能组按字母表的字母细分为KOG分类。在每个分类中,同源或同源蛋白组都有一个KOG ID。与COGs覆盖的原核基因组相比,可归为KOGs的真核基因比例要小得多;新的真核基因组的加入有望使KOGs的真核基因组覆盖率显著增加。研究发现,所有分析物种都存在一个保守的核心,占KOG集合的20%左右。KOG集合的这一守恒部分远远大于COG集合的始终存在部分(约1%的COG)。这种差异在一定程度上可能是由于涉及的真核生物基因组数量较少,但也可能揭示了真核生物作为一个支系的相对致密性和真核生物基因组的巨大进化稳定性。

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