磷酸化是添加磷酰基（PO3.） - 分子。在生物学中，磷酸化及其对应物脱磷酸化对许多细胞过程至关重要。大部分蛋白质（在真核生物中的蛋白质组的1/3-2/3之间）暂时磷酸化，糖，脂质和其他分子也是如此。磷酸化对于蛋白质功能尤为重要，因为这种修饰激活（或去激活）几乎一半的酶，从而调节它们的功能。蛋白质磷酸化被认为是真核生物中最丰富的翻译后修饰。糖的磷酸化通常是他们分解代谢的第一阶段。它允许细胞累积糖，因为磷酸基团防止分子在其运输器上扩散回来。葡萄糖的磷酸化是糖代谢的关键反应，因为在进一步代谢之前首先首先将许多糖转化为葡萄糖。
在活细胞中，磷酸化与呼吸有关，该呼吸在细胞的线粒体和光合作用中发生，该光合作用在叶绿体中进行。在代谢或光合作用过程中释放的能量在某些分子的富含能量磷酸盐键中捕获，最常见于腺苷三磷酸腺苷（ATP）的高能键。在氧化磷酸化的过程中，ATP形成与氧气吸收有关。在该方法中，称为NADH（各种辅酶之一）的细胞物质将氢化物离子（一个质子和两个电子）捐赠给所谓的电子传输链中的一系列酶中的第一酶。随着氢化物离子在链中从一种酶通过另一种酶，可用于从腺苷二磷酸（ADP）和无机磷酸盐中的ATP的形成。在电子传输链的端部或最低能级，氢化物离子与氧气和质子（氢离子）组合以形成水分子。磷酸化方法与细胞代谢相关，因为食物的代谢降解，例如葡萄糖，允许形成辅酶NADH。电子传输酶是细胞色素的复合聚合物，即含有铁血红素基团的蛋白质和各种辅酶。尚未理解化学能耦合到ATP合成的精确机制。在光合磷酸化或光学磷酸化中，降低辅酶NADPH的物质也将氢化物离子捐赠给电子传输系统，使得ATP由ADP和无机磷酸盐中的光学磷酸化合成; however, the coenzyme is produced from chemical reactions initiated by illuminated photosynthetic pigments instead of from metabolism of food molecules. The net result in phosphorylation of ADP is the formation of the high-energy molecule ATP, which the cell can use as a kind of universal energy currency to power many important cell processes, such as protein synthesis. Other phosphorylation reactions occur in cells, some without mediation by the electron transport chain, e.g., ATP is formed from ADP and inorganic phosphate in a reaction coupled to the oxidation of glyceraldehyde phosphate to phosphoglyceric acid.
由于磷酸化对生物过程的影响，一般而言，已经巨大地重视了解磷酸化化合物在人类疾病的背景下的生物学作用。研究磷酸化的电流方法包括免疫缩乳，磷蛋白或磷酸富集，激酶活性测定和质谱。通过使用LC-MS / MS方法，创造性蛋白质组学提供可靠，快速且经济高效的磷酸化化合物靶向代谢组服务。
图1所示。LC-MS/MS法鉴别和定量磷酸己糖。
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