与配体分子的相互作用对于许多蛋白质来进行其生物学功能非常重要。这种相互作用通常是特异性的，不仅就涉及相互作用的蛋白质分子而言，而且还在其中在该相互作用发生的位置（即配体结合位点）。有两个流行的模型如何适合其特定的基板：诱导的拟合模型和锁和钥匙模型。结合位点中的残基通过形成氢键，疏水相互作用或临时范德瓦尔斯相互作用而与配体相互作用以使蛋白质 - 配体络合物相互作用。蛋白质配体结合位点预测可以帮助我们妥善了解配体和蛋白质分子之间的结合机制，辅助药物发现。现在，在创意蛋白质组学的生物信息管理员很自豪地告诉你我们可以帮助您帮助您蛋白质配体结合位点预测服务！

In order to gain knowledge about the interaction, the protein molecule’s function and how to influence its activity by, for example, designing small molecule drugs, great efforts have been made to develop approaches that can predict ligand binding sites (LBSs) of proteins computationally, and a large number of ligand computational biology tools are now available for LBS prediction. In general, due to the location specificity of LBSs, the majority of these methods have exploited one or more of four types of properties (geometric, energetic, statistical, and evolutionary) in order to distinguish the ligand binding site from other parts of the protein surface.

根据现场区分性质的基础，可以将创造性蛋白质组学提供的蛋白质配体结合位点预测可以分类为以下几类：

• 基于模板：使用具有已知结合位点的同源或类似结构的模板
• 基于几何的：执行某种几何计算的人，以识别装订部位口袋
• 基于能量的：使用假想配体作为绑定探针计算相互作用能量的能量
• 基于倾向：计算某种性质的倾向的那些，该属性表示统计学上显着的偏好，而不是非磅
• 基于组合和其他：根据其他方法的结果和不能轻易分类为上述类别之一的结果，执行预测的那些

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