在结构生物学,蛋白质二级结构是蛋白质局部段的一般三维形式。α螺旋和β床单是最常见的蛋白质二级结构。二级结构未描述被定义为主要结构的蛋白质氨基酸的特定同一性，也不是三维空间中的全球原子位置，其被认为是三维结构。其他类型的生物聚合物如核酸也具有特征性二次结构。从氨基酸序列预测蛋白质三级结构是一个非常具有挑战性的问题，但使用更简单的二级结构定义更具易行。二级结构预测是生物信息学中的一系列技术，其目的仅基于其主要结构的知识来预测蛋白质序列的二次结构。现在，在创意蛋白质组学的生物信息管理员很自豪地告诉你我们可以帮助您帮助您蛋白质二级结构预测服务！
二次结构预测的早期方法仅限于预测三个占主导地位：螺旋，片材和随机线圈。这些方法通常准确地预测三种氨基酸残基采用的哪三种态度。通过使用多个序列对准进行准确性（近80％）的大大增加;了解在整个进化中发生在一个位置发生的氨基酸的完全分布在该位置附近的结构趋势上提供了更好的图像。为了解释，给定的蛋白质可能在特定位置具有甘氨酸，其本身可以支持那里的随机线圈。然而，多种序列对准可能表明，在该位置（和附近的位置）在95％的同源蛋白质中出现螺旋纤维氨基酸在跨越大约十亿年的进化。更重要的是，通过检查该位置和附近位置的平均疏水性，相同的对准也可能表明残留物溶剂可访问性的模式，其符合α-螺旋。在一起，这些因素表明该原始蛋白质的甘氨酸是α-螺旋结构，而不是随机线圈。应用多种类型的方法来组合所有可用数据以执行3状态预测，例如神经网络，隐马尔可夫模型和支持向量机。高级预测方法也可以计算每个位置的预测的置信度分数。
二次结构预测的准确性是在最简单（同源性建模）案例之外的三级结构中预测的关键元素。Creative Proteomics可以提供多种二级结构预测方法，包括:
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