呼吸Quinones分析


环境样本中的细菌呼吸醌类化合物被认为是细菌群体有氧代谢和厌氧代谢的敏感指标。在微生物生态学的许多领域中,提高环境样品中有氧和厌氧代谢相对丰度的测量能力是非常有用的。例如,当环境污染物在好氧环境和厌氧环境中经历不同的生物降解速率或途径时,该方法可以提供预测能力。

呼吸Quinones分析图1不同类型呼吸醌类化合物的合成过程

如前所述,环境样品中有氧和厌氧代谢的重要性已被认识到。然而,许多样品无法直接测量氧化还原电位或溶解氧。此外,用电镀或其他技术来列举好氧微生物和厌氧微生物是不够准确的。细菌呼吸醌类化合物被认为是微生物环境中能量代谢类型的生物标志物。

常见的细菌呼吸醌类可分为三类:泛素类(UQ, l-甲基-2-异戊二烯基-3,4-二甲氧基苯甲酸醌)、甲萘醌类(MK, 1-异戊二烯基-2-甲基萘醌)和去甲基甲萘醌类(DMK, 1-异戊二烯基萘醌)。这三种类型的醌都属于一个同源系列化合物。这些化合物之间的主要区别是侧链上异戊二烯单元的数量。此外,醌的类型和侧链的长度取决于细菌的类型和环境条件。泛素是在真核生物中发现的呼吸醌类物质,在某些革兰氏阴性菌中存在。革兰氏阴性菌、革兰氏阳性菌和古菌中均可发现甲萘醌类。但去甲基甲萘醌的分布并不广泛,仅在部分致病性肠杆菌和粪链球菌中发现。醌类化合物在细菌群落中的含量随氧的可用性变化而变化,因此醌类化合物可广泛用于细菌的分类标记。

为了分析呼吸Quinones,创造性蛋白质组学遵循下面所示的程序。硅胶上的薄层色谱法用于将呼吸醌分离成不同的类别,其中己烷:叔丁基甲醚(9:1V / v)作为溶剂。之后,从板上除去对应于不同醌类的UV吸收带,并通过HPLC进一步分析。在使用甲醇:庚烷9:1(v / v)的LDC分析HPLC上对具有反相柱配备的LDC分析HPLC进行,作为流动相。在269nm处检测到呼吸醌。

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