短链脂肪酸(SCFAs)是饱和脂肪脂肪酸的一个亚群，包含2-5个碳(C)原子，其中乙酸(C2)、丙酸(C3)和丁酸(C4)最为丰富。它们是有益的大型肠道细菌发酵膳食纤维的最终产物。人类没有降解大部分膳食纤维的酶。因此，这些不可消化的膳食纤维不经消化通过上消化道，然后进入盲肠和大肠，并由厌氧盲肠和结肠微生物群发酵。膳食纤维发酵产生大量的代谢产物，包括短链脂肪酸(SCFAs)。
对于微生物群落来说，SCFAs是无用的最终产物，然而，它们需要维持厌氧环境中肠道氧化还原等效产物的平衡。在结肠和粪便中，醋酸、丙酸和丁酸的摩尔比约为60:20:20。近端结肠SCFAs的总浓度范围为70mM至140mm，取决于饮食。在结肠远端，浓度较低，约为20mM ~ 70mm。盲肠和大肠中产生的SCFAs的95%迅速被结肠细胞吸收，剩下的5%在粪便中分泌。
在过去的几十年里，SCFAs在肠道疾病和一些癌症等一系列代谢综合征的预防和治疗中发挥着重要作用。在一些临床研究中，使用SCFAs可以提高一些免疫性肠道疾病的治疗效果，如克罗恩病、溃疡性结肠炎和抗生素相关性腹泻，但其机制仍有待确定。提示短链脂肪酸对哺乳动物的能量代谢具有显著的促进作用，其机制有待进一步研究。能量摄入过多，缺乏体育锻炼，导致高血压、肥胖、血脂异常、血糖失控等一系列代谢综合征。流行病学研究表明，摄入更多的膳食纤维有利于体重、食物摄入和葡萄糖稳态，并减少代谢紊乱的风险，如糖尿病、心血管疾病、肠易激综合征、炎症性肠病和结肠癌。这是因为膳食纤维被盲肠和大肠中的肠道细菌发酵，并产生有益的短链脂肪酸。
饮食中的膳食纤维的数量和类型对肠道细菌的组成具有显着影响，从而对产生的SCFA的类型和量进行了显着影响。大多数情况下，不同纤维的体内SCFA生产率与不同纤维饮食中的肠科学SCFA浓度有关。尽管大多数模型生物体中可用的盲肠SCFA浓度，但很难获得关于体内生产率的信息。相比之下，几乎不可能测量人类肠中的盲肠SCFA浓度。因此，大多数时间通过测量粪便含量的SCFA浓度或通过体外研究来评估盲肠和结肠新陈代谢。创意蛋白质组学已经建立了敏感，可靠，准确的GC-MS方法，用于量化短链脂肪酸．
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