一种信号肽有时还称为信号序列,靶向信号,定位信号,定位序列,过渡肽或领导肽。它是一种短的,通常为5-30个氨基酸长,存在于大多数新合成蛋白质的N-末端的肽。这些蛋白质包括那些居住在某些细胞器(Golgi或内质网)内部分泌的那些,或插入大多数细胞膜中。尽管大多数I型膜结合蛋白具有信号肽,但是大多数II型和多跨越膜结合蛋白通过其第一跨膜结构域靶向这些秘书途径,其在裂解后生物化学上类似于信号序列。现在,在创意蛋白质组学的生物信息管理员很自豪地告诉你我们可以帮助您帮助您信号肽预测服务!
信号肽的核心包括长段的疏水性氨基酸(约5-16个残基),其具有形成单个α-螺旋(也称为“H区域”)的趋势。此外,许多信号肽从氨基酸的短带电荷部分开始,这可能有助于在易位期间形成多肽的适当拓扑。由于其靠近N末端的位置,它被称为“n区域”。在信号肽的末端,通常存在通过信号肽酶检测和切割的氨基酸的拉伸,因此称为切割位点。
由Creative蛋白质组学提供的信号肽预测服务中使用的方法包括:
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