火山情节服务


在统计数据,火山的阴谋是一种散点图,用于快速查找由复制数据组成的大数据集中的变化。它分别在x轴和y轴上绘制了折叠变化与显著性的关系图。这些图谱越来越广泛地应用于基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学等组学实验中,在这些实验中,一个人通常有一个长长的清单,上面有两种不同条件之间的数千个重复数据点,一个人希望快速识别出最显著的变化。火山图结合了来自统计检验的统计显著性度量(例如,来自方差分析模型的p值)和震级变化,能够快速直观地确定这些代表在统计上显著的大震级变化的数据点。

火山情节服务

在火山图中,y轴是p值的负对数(通常以10为底)。这导致了高度显著的点,低p值出现在图的顶部。在x轴上标出了两种情况之间的折叠变化(FC)的对数。采用了褶皱变化的对数,使两个方向的变化距离中心相等。以这种方式绘制点在情节中形成两个感兴趣的区域:那些在情节顶部被发现的点,要么在左边,要么在右边。这些代表的值显示了较大的量级fold变化以及高的统计意义。

火山图显示噪音级标准化和非标准化信号,涉及信使rna水平的差异表达。正则化检验统计量和联合过滤在火山图上具有直观的几何解释,其优于基因双过滤准则的优点易于理解。火山图作为一个散射图,可以合并其他外部信息,如基因注释,以帮助产生有关疾病或表现型的假设过程。

火山图的应用:

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